Protein–RNA interactions for Protein: Q96SK2

TMEM209, Transmembrane protein 209, humanhuman

Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM209Q96SK2 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM209Q96SK2 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM209Q96SK2 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM209Q96SK2 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM209Q96SK2 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM209Q96SK2 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM209Q96SK2 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM209Q96SK2 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMEM209Q96SK2 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMEM209Q96SK2 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMEM209Q96SK2 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMEM209Q96SK2 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMEM209Q96SK2 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMEM209Q96SK2 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMEM209Q96SK2 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMEM209Q96SK2 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMEM209Q96SK2 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMEM209Q96SK2 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMEM209Q96SK2 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMEM209Q96SK2 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMEM209Q96SK2 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMEM209Q96SK2 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMEM209Q96SK2 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMEM209Q96SK2 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
TMEM209Q96SK2 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMEM209Q96SK2 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMEM209Q96SK2 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
TMEM209Q96SK2 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TMEM209Q96SK2 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM209Q96SK2 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM209Q96SK2 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM209Q96SK2 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM209Q96SK2 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM209Q96SK2 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM209Q96SK2 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM209Q96SK2 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM209Q96SK2 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM209Q96SK2 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM209Q96SK2 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM209Q96SK2 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM209Q96SK2 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM209Q96SK2 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM209Q96SK2 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM209Q96SK2 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM209Q96SK2 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM209Q96SK2 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM209Q96SK2 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM209Q96SK2 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM209Q96SK2 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM209Q96SK2 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM209Q96SK2 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM209Q96SK2 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM209Q96SK2 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM209Q96SK2 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM209Q96SK2 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM209Q96SK2 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM209Q96SK2 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM209Q96SK2 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM209Q96SK2 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM209Q96SK2 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM209Q96SK2 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEM209Q96SK2 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEM209Q96SK2 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEM209Q96SK2 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEM209Q96SK2 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEM209Q96SK2 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEM209Q96SK2 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEM209Q96SK2 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEM209Q96SK2 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEM209Q96SK2 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEM209Q96SK2 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEM209Q96SK2 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEM209Q96SK2 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEM209Q96SK2 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEM209Q96SK2 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMEM209Q96SK2 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMEM209Q96SK2 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMEM209Q96SK2 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMEM209Q96SK2 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMEM209Q96SK2 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMEM209Q96SK2 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMEM209Q96SK2 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMEM209Q96SK2 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TMEM209Q96SK2 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TMEM209Q96SK2 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TMEM209Q96SK2 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMEM209Q96SK2 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMEM209Q96SK2 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMEM209Q96SK2 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMEM209Q96SK2 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMEM209Q96SK2 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMEM209Q96SK2 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMEM209Q96SK2 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMEM209Q96SK2 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TMEM209Q96SK2 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMEM209Q96SK2 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMEM209Q96SK2 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMEM209Q96SK2 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TMEM209Q96SK2 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMEM209Q96SK2 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms