Protein–RNA interactions for Protein: Q96SB4

SRPK1, SRSF protein kinase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPK1Q96SB4 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SRPK1Q96SB4 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SRPK1Q96SB4 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SRPK1Q96SB4 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SRPK1Q96SB4 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SRPK1Q96SB4 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SRPK1Q96SB4 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SRPK1Q96SB4 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SRPK1Q96SB4 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SRPK1Q96SB4 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SRPK1Q96SB4 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SRPK1Q96SB4 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SRPK1Q96SB4 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SRPK1Q96SB4 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SRPK1Q96SB4 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SRPK1Q96SB4 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SRPK1Q96SB4 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SRPK1Q96SB4 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SRPK1Q96SB4 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SRPK1Q96SB4 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SRPK1Q96SB4 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SRPK1Q96SB4 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SRPK1Q96SB4 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SRPK1Q96SB4 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SRPK1Q96SB4 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SRPK1Q96SB4 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SRPK1Q96SB4 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SRPK1Q96SB4 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SRPK1Q96SB4 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SRPK1Q96SB4 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SRPK1Q96SB4 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SRPK1Q96SB4 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SRPK1Q96SB4 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SRPK1Q96SB4 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SRPK1Q96SB4 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SRPK1Q96SB4 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SRPK1Q96SB4 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SRPK1Q96SB4 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SRPK1Q96SB4 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SRPK1Q96SB4 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
SRPK1Q96SB4 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SRPK1Q96SB4 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SRPK1Q96SB4 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SRPK1Q96SB4 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SRPK1Q96SB4 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SRPK1Q96SB4 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SRPK1Q96SB4 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SRPK1Q96SB4 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SRPK1Q96SB4 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SRPK1Q96SB4 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SRPK1Q96SB4 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SRPK1Q96SB4 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SRPK1Q96SB4 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SRPK1Q96SB4 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SRPK1Q96SB4 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SRPK1Q96SB4 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SRPK1Q96SB4 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SRPK1Q96SB4 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SRPK1Q96SB4 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SRPK1Q96SB4 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SRPK1Q96SB4 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SRPK1Q96SB4 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SRPK1Q96SB4 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SRPK1Q96SB4 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SRPK1Q96SB4 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SRPK1Q96SB4 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SRPK1Q96SB4 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SRPK1Q96SB4 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SRPK1Q96SB4 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SRPK1Q96SB4 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SRPK1Q96SB4 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SRPK1Q96SB4 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SRPK1Q96SB4 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SRPK1Q96SB4 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SRPK1Q96SB4 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SRPK1Q96SB4 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SRPK1Q96SB4 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SRPK1Q96SB4 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SRPK1Q96SB4 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SRPK1Q96SB4 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SRPK1Q96SB4 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SRPK1Q96SB4 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SRPK1Q96SB4 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SRPK1Q96SB4 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SRPK1Q96SB4 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SRPK1Q96SB4 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SRPK1Q96SB4 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SRPK1Q96SB4 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SRPK1Q96SB4 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SRPK1Q96SB4 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SRPK1Q96SB4 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SRPK1Q96SB4 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SRPK1Q96SB4 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SRPK1Q96SB4 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SRPK1Q96SB4 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SRPK1Q96SB4 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SRPK1Q96SB4 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SRPK1Q96SB4 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SRPK1Q96SB4 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SRPK1Q96SB4 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms