Protein–RNA interactions for Protein: Q96RY5

CRAMP1, Protein cramped-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRAMP1Q96RY5 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CRAMP1Q96RY5 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CRAMP1Q96RY5 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CRAMP1Q96RY5 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CRAMP1Q96RY5 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CRAMP1Q96RY5 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CRAMP1Q96RY5 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CRAMP1Q96RY5 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CRAMP1Q96RY5 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CRAMP1Q96RY5 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
CRAMP1Q96RY5 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CRAMP1Q96RY5 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CRAMP1Q96RY5 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CRAMP1Q96RY5 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CRAMP1Q96RY5 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CRAMP1Q96RY5 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
CRAMP1Q96RY5 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CRAMP1Q96RY5 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CRAMP1Q96RY5 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CRAMP1Q96RY5 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CRAMP1Q96RY5 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CRAMP1Q96RY5 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CRAMP1Q96RY5 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
CRAMP1Q96RY5 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CRAMP1Q96RY5 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CRAMP1Q96RY5 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CRAMP1Q96RY5 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
CRAMP1Q96RY5 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CRAMP1Q96RY5 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CRAMP1Q96RY5 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CRAMP1Q96RY5 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CRAMP1Q96RY5 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CRAMP1Q96RY5 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CRAMP1Q96RY5 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CRAMP1Q96RY5 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CRAMP1Q96RY5 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CRAMP1Q96RY5 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CRAMP1Q96RY5 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CRAMP1Q96RY5 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CRAMP1Q96RY5 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CRAMP1Q96RY5 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CRAMP1Q96RY5 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CRAMP1Q96RY5 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CRAMP1Q96RY5 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CRAMP1Q96RY5 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CRAMP1Q96RY5 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CRAMP1Q96RY5 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CRAMP1Q96RY5 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CRAMP1Q96RY5 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CRAMP1Q96RY5 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CRAMP1Q96RY5 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CRAMP1Q96RY5 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CRAMP1Q96RY5 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
CRAMP1Q96RY5 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CRAMP1Q96RY5 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CRAMP1Q96RY5 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CRAMP1Q96RY5 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CRAMP1Q96RY5 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CRAMP1Q96RY5 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CRAMP1Q96RY5 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CRAMP1Q96RY5 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CRAMP1Q96RY5 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CRAMP1Q96RY5 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CRAMP1Q96RY5 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
CRAMP1Q96RY5 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CRAMP1Q96RY5 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CRAMP1Q96RY5 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
CRAMP1Q96RY5 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CRAMP1Q96RY5 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CRAMP1Q96RY5 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
CRAMP1Q96RY5 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CRAMP1Q96RY5 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
CRAMP1Q96RY5 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CRAMP1Q96RY5 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CRAMP1Q96RY5 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CRAMP1Q96RY5 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CRAMP1Q96RY5 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CRAMP1Q96RY5 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CRAMP1Q96RY5 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CRAMP1Q96RY5 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CRAMP1Q96RY5 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CRAMP1Q96RY5 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CRAMP1Q96RY5 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CRAMP1Q96RY5 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CRAMP1Q96RY5 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CRAMP1Q96RY5 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CRAMP1Q96RY5 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
CRAMP1Q96RY5 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CRAMP1Q96RY5 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CRAMP1Q96RY5 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CRAMP1Q96RY5 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CRAMP1Q96RY5 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CRAMP1Q96RY5 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CRAMP1Q96RY5 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CRAMP1Q96RY5 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
CRAMP1Q96RY5 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
CRAMP1Q96RY5 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CRAMP1Q96RY5 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CRAMP1Q96RY5 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CRAMP1Q96RY5 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms