Protein–RNA interactions for Protein: Q96RS0

TGS1, Trimethylguanosine synthase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 853 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGS1Q96RS0 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TGS1Q96RS0 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TGS1Q96RS0 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TGS1Q96RS0 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TGS1Q96RS0 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TGS1Q96RS0 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TGS1Q96RS0 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TGS1Q96RS0 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TGS1Q96RS0 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TGS1Q96RS0 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TGS1Q96RS0 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TGS1Q96RS0 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TGS1Q96RS0 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TGS1Q96RS0 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
TGS1Q96RS0 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TGS1Q96RS0 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TGS1Q96RS0 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TGS1Q96RS0 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
TGS1Q96RS0 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
TGS1Q96RS0 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TGS1Q96RS0 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
TGS1Q96RS0 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
TGS1Q96RS0 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TGS1Q96RS0 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TGS1Q96RS0 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TGS1Q96RS0 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TGS1Q96RS0 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TGS1Q96RS0 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TGS1Q96RS0 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TGS1Q96RS0 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
TGS1Q96RS0 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TGS1Q96RS0 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TGS1Q96RS0 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TGS1Q96RS0 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TGS1Q96RS0 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TGS1Q96RS0 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TGS1Q96RS0 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TGS1Q96RS0 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TGS1Q96RS0 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
TGS1Q96RS0 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TGS1Q96RS0 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TGS1Q96RS0 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TGS1Q96RS0 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TGS1Q96RS0 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TGS1Q96RS0 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TGS1Q96RS0 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TGS1Q96RS0 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TGS1Q96RS0 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TGS1Q96RS0 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TGS1Q96RS0 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TGS1Q96RS0 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TGS1Q96RS0 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
TGS1Q96RS0 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TGS1Q96RS0 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TGS1Q96RS0 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TGS1Q96RS0 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TGS1Q96RS0 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TGS1Q96RS0 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TGS1Q96RS0 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
TGS1Q96RS0 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TGS1Q96RS0 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TGS1Q96RS0 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TGS1Q96RS0 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
TGS1Q96RS0 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TGS1Q96RS0 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TGS1Q96RS0 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TGS1Q96RS0 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TGS1Q96RS0 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TGS1Q96RS0 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
TGS1Q96RS0 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TGS1Q96RS0 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TGS1Q96RS0 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TGS1Q96RS0 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.43
TGS1Q96RS0 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
TGS1Q96RS0 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
TGS1Q96RS0 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
TGS1Q96RS0 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TGS1Q96RS0 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TGS1Q96RS0 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TGS1Q96RS0 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TGS1Q96RS0 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TGS1Q96RS0 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TGS1Q96RS0 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TGS1Q96RS0 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TGS1Q96RS0 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TGS1Q96RS0 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
TGS1Q96RS0 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TGS1Q96RS0 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TGS1Q96RS0 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TGS1Q96RS0 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TGS1Q96RS0 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TGS1Q96RS0 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TGS1Q96RS0 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TGS1Q96RS0 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TGS1Q96RS0 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TGS1Q96RS0 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TGS1Q96RS0 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TGS1Q96RS0 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TGS1Q96RS0 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TGS1Q96RS0 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms