Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q11

TRNT1, CCA tRNA nucleotidyltransferase 1, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 434 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRNT1Q96Q11 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRNT1Q96Q11 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRNT1Q96Q11 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRNT1Q96Q11 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRNT1Q96Q11 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRNT1Q96Q11 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRNT1Q96Q11 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
TRNT1Q96Q11 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRNT1Q96Q11 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRNT1Q96Q11 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRNT1Q96Q11 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRNT1Q96Q11 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRNT1Q96Q11 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRNT1Q96Q11 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRNT1Q96Q11 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRNT1Q96Q11 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRNT1Q96Q11 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRNT1Q96Q11 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRNT1Q96Q11 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRNT1Q96Q11 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRNT1Q96Q11 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRNT1Q96Q11 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
TRNT1Q96Q11 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
TRNT1Q96Q11 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRNT1Q96Q11 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRNT1Q96Q11 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRNT1Q96Q11 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRNT1Q96Q11 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRNT1Q96Q11 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRNT1Q96Q11 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRNT1Q96Q11 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRNT1Q96Q11 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRNT1Q96Q11 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRNT1Q96Q11 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRNT1Q96Q11 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRNT1Q96Q11 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRNT1Q96Q11 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRNT1Q96Q11 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
TRNT1Q96Q11 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRNT1Q96Q11 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRNT1Q96Q11 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRNT1Q96Q11 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRNT1Q96Q11 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
TRNT1Q96Q11 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRNT1Q96Q11 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRNT1Q96Q11 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRNT1Q96Q11 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRNT1Q96Q11 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRNT1Q96Q11 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRNT1Q96Q11 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRNT1Q96Q11 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
TRNT1Q96Q11 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRNT1Q96Q11 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRNT1Q96Q11 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRNT1Q96Q11 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRNT1Q96Q11 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRNT1Q96Q11 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRNT1Q96Q11 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRNT1Q96Q11 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRNT1Q96Q11 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRNT1Q96Q11 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
TRNT1Q96Q11 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRNT1Q96Q11 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRNT1Q96Q11 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRNT1Q96Q11 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRNT1Q96Q11 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRNT1Q96Q11 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRNT1Q96Q11 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRNT1Q96Q11 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRNT1Q96Q11 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRNT1Q96Q11 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRNT1Q96Q11 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRNT1Q96Q11 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRNT1Q96Q11 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRNT1Q96Q11 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRNT1Q96Q11 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRNT1Q96Q11 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRNT1Q96Q11 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRNT1Q96Q11 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRNT1Q96Q11 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRNT1Q96Q11 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRNT1Q96Q11 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRNT1Q96Q11 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRNT1Q96Q11 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRNT1Q96Q11 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRNT1Q96Q11 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRNT1Q96Q11 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRNT1Q96Q11 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRNT1Q96Q11 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRNT1Q96Q11 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRNT1Q96Q11 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRNT1Q96Q11 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRNT1Q96Q11 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRNT1Q96Q11 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRNT1Q96Q11 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
TRNT1Q96Q11 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRNT1Q96Q11 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRNT1Q96Q11 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRNT1Q96Q11 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRNT1Q96Q11 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
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