Protein–RNA interactions for Protein: Q96MR6

CFAP57, Cilia- and flagella-associated protein 57, humanhuman

Predictions only

Length 1,250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP57Q96MR6 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CFAP57Q96MR6 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CFAP57Q96MR6 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CFAP57Q96MR6 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CFAP57Q96MR6 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CFAP57Q96MR6 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CFAP57Q96MR6 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CFAP57Q96MR6 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CFAP57Q96MR6 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CFAP57Q96MR6 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CFAP57Q96MR6 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CFAP57Q96MR6 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CFAP57Q96MR6 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CFAP57Q96MR6 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CFAP57Q96MR6 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CFAP57Q96MR6 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CFAP57Q96MR6 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CFAP57Q96MR6 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CFAP57Q96MR6 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CFAP57Q96MR6 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CFAP57Q96MR6 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CFAP57Q96MR6 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CFAP57Q96MR6 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CFAP57Q96MR6 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CFAP57Q96MR6 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CFAP57Q96MR6 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CFAP57Q96MR6 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CFAP57Q96MR6 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CFAP57Q96MR6 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CFAP57Q96MR6 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CFAP57Q96MR6 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CFAP57Q96MR6 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CFAP57Q96MR6 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CFAP57Q96MR6 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CFAP57Q96MR6 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CFAP57Q96MR6 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CFAP57Q96MR6 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CFAP57Q96MR6 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CFAP57Q96MR6 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CFAP57Q96MR6 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CFAP57Q96MR6 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CFAP57Q96MR6 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CFAP57Q96MR6 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CFAP57Q96MR6 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CFAP57Q96MR6 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CFAP57Q96MR6 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CFAP57Q96MR6 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CFAP57Q96MR6 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CFAP57Q96MR6 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CFAP57Q96MR6 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CFAP57Q96MR6 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CFAP57Q96MR6 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CFAP57Q96MR6 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CFAP57Q96MR6 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CFAP57Q96MR6 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CFAP57Q96MR6 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CFAP57Q96MR6 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CFAP57Q96MR6 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CFAP57Q96MR6 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CFAP57Q96MR6 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CFAP57Q96MR6 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CFAP57Q96MR6 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CFAP57Q96MR6 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CFAP57Q96MR6 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CFAP57Q96MR6 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CFAP57Q96MR6 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CFAP57Q96MR6 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CFAP57Q96MR6 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CFAP57Q96MR6 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CFAP57Q96MR6 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CFAP57Q96MR6 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CFAP57Q96MR6 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CFAP57Q96MR6 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CFAP57Q96MR6 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CFAP57Q96MR6 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CFAP57Q96MR6 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CFAP57Q96MR6 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CFAP57Q96MR6 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CFAP57Q96MR6 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CFAP57Q96MR6 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CFAP57Q96MR6 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CFAP57Q96MR6 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CFAP57Q96MR6 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CFAP57Q96MR6 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CFAP57Q96MR6 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CFAP57Q96MR6 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CFAP57Q96MR6 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CFAP57Q96MR6 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CFAP57Q96MR6 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CFAP57Q96MR6 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CFAP57Q96MR6 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CFAP57Q96MR6 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CFAP57Q96MR6 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CFAP57Q96MR6 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CFAP57Q96MR6 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CFAP57Q96MR6 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CFAP57Q96MR6 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CFAP57Q96MR6 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CFAP57Q96MR6 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CFAP57Q96MR6 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms