Protein–RNA interactions for Protein: Q96M89

CCDC138, Coiled-coil domain-containing protein 138, humanhuman

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC138Q96M89 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC138Q96M89 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC138Q96M89 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC138Q96M89 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC138Q96M89 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC138Q96M89 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC138Q96M89 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC138Q96M89 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC138Q96M89 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC138Q96M89 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC138Q96M89 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC138Q96M89 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC138Q96M89 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC138Q96M89 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC138Q96M89 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC138Q96M89 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC138Q96M89 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC138Q96M89 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC138Q96M89 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC138Q96M89 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC138Q96M89 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC138Q96M89 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC138Q96M89 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC138Q96M89 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC138Q96M89 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC138Q96M89 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC138Q96M89 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC138Q96M89 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC138Q96M89 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC138Q96M89 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC138Q96M89 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC138Q96M89 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC138Q96M89 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC138Q96M89 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC138Q96M89 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC138Q96M89 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC138Q96M89 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC138Q96M89 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC138Q96M89 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC138Q96M89 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC138Q96M89 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC138Q96M89 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC138Q96M89 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC138Q96M89 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC138Q96M89 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC138Q96M89 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC138Q96M89 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC138Q96M89 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC138Q96M89 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC138Q96M89 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC138Q96M89 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC138Q96M89 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC138Q96M89 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC138Q96M89 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC138Q96M89 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC138Q96M89 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC138Q96M89 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC138Q96M89 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC138Q96M89 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC138Q96M89 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC138Q96M89 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC138Q96M89 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC138Q96M89 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC138Q96M89 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC138Q96M89 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC138Q96M89 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC138Q96M89 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC138Q96M89 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC138Q96M89 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC138Q96M89 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC138Q96M89 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC138Q96M89 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC138Q96M89 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC138Q96M89 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC138Q96M89 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC138Q96M89 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC138Q96M89 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC138Q96M89 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC138Q96M89 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC138Q96M89 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC138Q96M89 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC138Q96M89 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC138Q96M89 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC138Q96M89 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC138Q96M89 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC138Q96M89 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC138Q96M89 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC138Q96M89 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC138Q96M89 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC138Q96M89 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC138Q96M89 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC138Q96M89 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC138Q96M89 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC138Q96M89 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC138Q96M89 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC138Q96M89 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC138Q96M89 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC138Q96M89 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC138Q96M89 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC138Q96M89 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms