Protein–RNA interactions for Protein: Q96KX2

CAPZA3, F-actin-capping protein subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPZA3Q96KX2 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CAPZA3Q96KX2 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CAPZA3Q96KX2 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CAPZA3Q96KX2 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CAPZA3Q96KX2 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
CAPZA3Q96KX2 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
CAPZA3Q96KX2 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
CAPZA3Q96KX2 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CAPZA3Q96KX2 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CAPZA3Q96KX2 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CAPZA3Q96KX2 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CAPZA3Q96KX2 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CAPZA3Q96KX2 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CAPZA3Q96KX2 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CAPZA3Q96KX2 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CAPZA3Q96KX2 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CAPZA3Q96KX2 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CAPZA3Q96KX2 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CAPZA3Q96KX2 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CAPZA3Q96KX2 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CAPZA3Q96KX2 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CAPZA3Q96KX2 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CAPZA3Q96KX2 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CAPZA3Q96KX2 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CAPZA3Q96KX2 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CAPZA3Q96KX2 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CAPZA3Q96KX2 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CAPZA3Q96KX2 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CAPZA3Q96KX2 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CAPZA3Q96KX2 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CAPZA3Q96KX2 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CAPZA3Q96KX2 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CAPZA3Q96KX2 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CAPZA3Q96KX2 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CAPZA3Q96KX2 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CAPZA3Q96KX2 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CAPZA3Q96KX2 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CAPZA3Q96KX2 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CAPZA3Q96KX2 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CAPZA3Q96KX2 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CAPZA3Q96KX2 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CAPZA3Q96KX2 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CAPZA3Q96KX2 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CAPZA3Q96KX2 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CAPZA3Q96KX2 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CAPZA3Q96KX2 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CAPZA3Q96KX2 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CAPZA3Q96KX2 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CAPZA3Q96KX2 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CAPZA3Q96KX2 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CAPZA3Q96KX2 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CAPZA3Q96KX2 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CAPZA3Q96KX2 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CAPZA3Q96KX2 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CAPZA3Q96KX2 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CAPZA3Q96KX2 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CAPZA3Q96KX2 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CAPZA3Q96KX2 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CAPZA3Q96KX2 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CAPZA3Q96KX2 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CAPZA3Q96KX2 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CAPZA3Q96KX2 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CAPZA3Q96KX2 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CAPZA3Q96KX2 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CAPZA3Q96KX2 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CAPZA3Q96KX2 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CAPZA3Q96KX2 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CAPZA3Q96KX2 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CAPZA3Q96KX2 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CAPZA3Q96KX2 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CAPZA3Q96KX2 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CAPZA3Q96KX2 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CAPZA3Q96KX2 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CAPZA3Q96KX2 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CAPZA3Q96KX2 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CAPZA3Q96KX2 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC23.2■■□□□ 1.31
CAPZA3Q96KX2 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CAPZA3Q96KX2 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CAPZA3Q96KX2 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CAPZA3Q96KX2 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CAPZA3Q96KX2 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CAPZA3Q96KX2 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CAPZA3Q96KX2 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CAPZA3Q96KX2 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CAPZA3Q96KX2 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CAPZA3Q96KX2 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CAPZA3Q96KX2 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CAPZA3Q96KX2 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CAPZA3Q96KX2 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CAPZA3Q96KX2 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CAPZA3Q96KX2 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CAPZA3Q96KX2 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CAPZA3Q96KX2 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CAPZA3Q96KX2 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CAPZA3Q96KX2 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CAPZA3Q96KX2 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CAPZA3Q96KX2 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CAPZA3Q96KX2 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CAPZA3Q96KX2 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CAPZA3Q96KX2 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms