Protein–RNA interactions for Protein: Q96KR7

PHACTR3, Phosphatase and actin regulator 3, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR3Q96KR7 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PHACTR3Q96KR7 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PHACTR3Q96KR7 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PHACTR3Q96KR7 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PHACTR3Q96KR7 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PHACTR3Q96KR7 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PHACTR3Q96KR7 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PHACTR3Q96KR7 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PHACTR3Q96KR7 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
PHACTR3Q96KR7 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PHACTR3Q96KR7 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PHACTR3Q96KR7 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PHACTR3Q96KR7 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PHACTR3Q96KR7 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PHACTR3Q96KR7 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PHACTR3Q96KR7 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
PHACTR3Q96KR7 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PHACTR3Q96KR7 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
PHACTR3Q96KR7 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PHACTR3Q96KR7 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
PHACTR3Q96KR7 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
PHACTR3Q96KR7 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PHACTR3Q96KR7 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PHACTR3Q96KR7 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PHACTR3Q96KR7 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PHACTR3Q96KR7 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PHACTR3Q96KR7 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PHACTR3Q96KR7 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PHACTR3Q96KR7 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PHACTR3Q96KR7 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PHACTR3Q96KR7 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
PHACTR3Q96KR7 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
PHACTR3Q96KR7 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PHACTR3Q96KR7 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PHACTR3Q96KR7 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PHACTR3Q96KR7 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PHACTR3Q96KR7 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PHACTR3Q96KR7 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PHACTR3Q96KR7 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
PHACTR3Q96KR7 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PHACTR3Q96KR7 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PHACTR3Q96KR7 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PHACTR3Q96KR7 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PHACTR3Q96KR7 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PHACTR3Q96KR7 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PHACTR3Q96KR7 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PHACTR3Q96KR7 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PHACTR3Q96KR7 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PHACTR3Q96KR7 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
PHACTR3Q96KR7 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PHACTR3Q96KR7 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PHACTR3Q96KR7 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PHACTR3Q96KR7 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PHACTR3Q96KR7 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PHACTR3Q96KR7 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PHACTR3Q96KR7 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PHACTR3Q96KR7 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PHACTR3Q96KR7 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PHACTR3Q96KR7 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PHACTR3Q96KR7 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PHACTR3Q96KR7 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
PHACTR3Q96KR7 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PHACTR3Q96KR7 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
PHACTR3Q96KR7 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
PHACTR3Q96KR7 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
PHACTR3Q96KR7 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
PHACTR3Q96KR7 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
PHACTR3Q96KR7 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC28.95■■■□□ 2.22
PHACTR3Q96KR7 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
PHACTR3Q96KR7 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
PHACTR3Q96KR7 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
PHACTR3Q96KR7 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PHACTR3Q96KR7 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PHACTR3Q96KR7 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PHACTR3Q96KR7 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PHACTR3Q96KR7 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
PHACTR3Q96KR7 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PHACTR3Q96KR7 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PHACTR3Q96KR7 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
PHACTR3Q96KR7 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PHACTR3Q96KR7 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PHACTR3Q96KR7 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
PHACTR3Q96KR7 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
PHACTR3Q96KR7 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PHACTR3Q96KR7 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PHACTR3Q96KR7 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PHACTR3Q96KR7 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PHACTR3Q96KR7 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PHACTR3Q96KR7 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PHACTR3Q96KR7 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PHACTR3Q96KR7 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PHACTR3Q96KR7 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PHACTR3Q96KR7 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PHACTR3Q96KR7 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PHACTR3Q96KR7 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PHACTR3Q96KR7 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PHACTR3Q96KR7 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PHACTR3Q96KR7 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PHACTR3Q96KR7 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PHACTR3Q96KR7 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms