Protein–RNA interactions for Protein: Q96JY6

PDLIM2, PDZ and LIM domain protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDLIM2Q96JY6 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDLIM2Q96JY6 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDLIM2Q96JY6 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PDLIM2Q96JY6 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDLIM2Q96JY6 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDLIM2Q96JY6 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDLIM2Q96JY6 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDLIM2Q96JY6 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDLIM2Q96JY6 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDLIM2Q96JY6 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDLIM2Q96JY6 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDLIM2Q96JY6 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDLIM2Q96JY6 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDLIM2Q96JY6 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDLIM2Q96JY6 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDLIM2Q96JY6 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDLIM2Q96JY6 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PDLIM2Q96JY6 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PDLIM2Q96JY6 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PDLIM2Q96JY6 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PDLIM2Q96JY6 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PDLIM2Q96JY6 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PDLIM2Q96JY6 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDLIM2Q96JY6 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDLIM2Q96JY6 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDLIM2Q96JY6 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDLIM2Q96JY6 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDLIM2Q96JY6 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDLIM2Q96JY6 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PDLIM2Q96JY6 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PDLIM2Q96JY6 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDLIM2Q96JY6 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDLIM2Q96JY6 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDLIM2Q96JY6 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDLIM2Q96JY6 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PDLIM2Q96JY6 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PDLIM2Q96JY6 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PDLIM2Q96JY6 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PDLIM2Q96JY6 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PDLIM2Q96JY6 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PDLIM2Q96JY6 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDLIM2Q96JY6 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDLIM2Q96JY6 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDLIM2Q96JY6 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDLIM2Q96JY6 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDLIM2Q96JY6 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDLIM2Q96JY6 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDLIM2Q96JY6 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDLIM2Q96JY6 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDLIM2Q96JY6 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDLIM2Q96JY6 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDLIM2Q96JY6 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDLIM2Q96JY6 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDLIM2Q96JY6 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDLIM2Q96JY6 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDLIM2Q96JY6 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDLIM2Q96JY6 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDLIM2Q96JY6 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDLIM2Q96JY6 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDLIM2Q96JY6 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDLIM2Q96JY6 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDLIM2Q96JY6 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDLIM2Q96JY6 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDLIM2Q96JY6 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDLIM2Q96JY6 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDLIM2Q96JY6 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDLIM2Q96JY6 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDLIM2Q96JY6 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDLIM2Q96JY6 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDLIM2Q96JY6 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDLIM2Q96JY6 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDLIM2Q96JY6 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDLIM2Q96JY6 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDLIM2Q96JY6 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDLIM2Q96JY6 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PDLIM2Q96JY6 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDLIM2Q96JY6 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDLIM2Q96JY6 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PDLIM2Q96JY6 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDLIM2Q96JY6 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDLIM2Q96JY6 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDLIM2Q96JY6 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDLIM2Q96JY6 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDLIM2Q96JY6 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDLIM2Q96JY6 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDLIM2Q96JY6 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDLIM2Q96JY6 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDLIM2Q96JY6 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDLIM2Q96JY6 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDLIM2Q96JY6 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDLIM2Q96JY6 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDLIM2Q96JY6 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDLIM2Q96JY6 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PDLIM2Q96JY6 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PDLIM2Q96JY6 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PDLIM2Q96JY6 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PDLIM2Q96JY6 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PDLIM2Q96JY6 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PDLIM2Q96JY6 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PDLIM2Q96JY6 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms