Protein–RNA interactions for Protein: Q96JQ0

DCHS1, Protocadherin-16, humanhuman

Predictions only

Length 3,298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCHS1Q96JQ0 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DCHS1Q96JQ0 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DCHS1Q96JQ0 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DCHS1Q96JQ0 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DCHS1Q96JQ0 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DCHS1Q96JQ0 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DCHS1Q96JQ0 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DCHS1Q96JQ0 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DCHS1Q96JQ0 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DCHS1Q96JQ0 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DCHS1Q96JQ0 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
DCHS1Q96JQ0 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DCHS1Q96JQ0 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DCHS1Q96JQ0 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DCHS1Q96JQ0 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DCHS1Q96JQ0 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DCHS1Q96JQ0 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DCHS1Q96JQ0 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DCHS1Q96JQ0 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DCHS1Q96JQ0 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DCHS1Q96JQ0 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
DCHS1Q96JQ0 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.02
DCHS1Q96JQ0 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
DCHS1Q96JQ0 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
DCHS1Q96JQ0 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DCHS1Q96JQ0 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DCHS1Q96JQ0 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DCHS1Q96JQ0 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DCHS1Q96JQ0 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DCHS1Q96JQ0 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DCHS1Q96JQ0 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
DCHS1Q96JQ0 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DCHS1Q96JQ0 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DCHS1Q96JQ0 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DCHS1Q96JQ0 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DCHS1Q96JQ0 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DCHS1Q96JQ0 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
DCHS1Q96JQ0 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
DCHS1Q96JQ0 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DCHS1Q96JQ0 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DCHS1Q96JQ0 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DCHS1Q96JQ0 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DCHS1Q96JQ0 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DCHS1Q96JQ0 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DCHS1Q96JQ0 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DCHS1Q96JQ0 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DCHS1Q96JQ0 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DCHS1Q96JQ0 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DCHS1Q96JQ0 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DCHS1Q96JQ0 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DCHS1Q96JQ0 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DCHS1Q96JQ0 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DCHS1Q96JQ0 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DCHS1Q96JQ0 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DCHS1Q96JQ0 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DCHS1Q96JQ0 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DCHS1Q96JQ0 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DCHS1Q96JQ0 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DCHS1Q96JQ0 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DCHS1Q96JQ0 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DCHS1Q96JQ0 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DCHS1Q96JQ0 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DCHS1Q96JQ0 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DCHS1Q96JQ0 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DCHS1Q96JQ0 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DCHS1Q96JQ0 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DCHS1Q96JQ0 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DCHS1Q96JQ0 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DCHS1Q96JQ0 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DCHS1Q96JQ0 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DCHS1Q96JQ0 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DCHS1Q96JQ0 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DCHS1Q96JQ0 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DCHS1Q96JQ0 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DCHS1Q96JQ0 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
DCHS1Q96JQ0 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DCHS1Q96JQ0 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DCHS1Q96JQ0 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DCHS1Q96JQ0 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DCHS1Q96JQ0 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DCHS1Q96JQ0 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DCHS1Q96JQ0 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DCHS1Q96JQ0 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DCHS1Q96JQ0 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
DCHS1Q96JQ0 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
DCHS1Q96JQ0 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DCHS1Q96JQ0 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DCHS1Q96JQ0 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DCHS1Q96JQ0 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DCHS1Q96JQ0 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DCHS1Q96JQ0 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DCHS1Q96JQ0 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DCHS1Q96JQ0 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DCHS1Q96JQ0 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
DCHS1Q96JQ0 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DCHS1Q96JQ0 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DCHS1Q96JQ0 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DCHS1Q96JQ0 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DCHS1Q96JQ0 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DCHS1Q96JQ0 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms