Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM3

CHAMP1, Chromosome alignment-maintaining phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAMP1Q96JM3 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CHAMP1Q96JM3 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CHAMP1Q96JM3 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.68
CHAMP1Q96JM3 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.68
CHAMP1Q96JM3 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CHAMP1Q96JM3 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CHAMP1Q96JM3 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CHAMP1Q96JM3 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CHAMP1Q96JM3 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CHAMP1Q96JM3 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CHAMP1Q96JM3 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CHAMP1Q96JM3 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CHAMP1Q96JM3 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CHAMP1Q96JM3 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CHAMP1Q96JM3 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CHAMP1Q96JM3 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CHAMP1Q96JM3 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CHAMP1Q96JM3 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CHAMP1Q96JM3 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CHAMP1Q96JM3 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CHAMP1Q96JM3 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CHAMP1Q96JM3 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CHAMP1Q96JM3 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CHAMP1Q96JM3 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CHAMP1Q96JM3 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CHAMP1Q96JM3 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CHAMP1Q96JM3 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CHAMP1Q96JM3 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CHAMP1Q96JM3 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CHAMP1Q96JM3 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CHAMP1Q96JM3 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CHAMP1Q96JM3 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CHAMP1Q96JM3 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CHAMP1Q96JM3 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CHAMP1Q96JM3 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CHAMP1Q96JM3 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CHAMP1Q96JM3 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CHAMP1Q96JM3 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CHAMP1Q96JM3 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CHAMP1Q96JM3 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CHAMP1Q96JM3 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CHAMP1Q96JM3 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CHAMP1Q96JM3 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CHAMP1Q96JM3 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CHAMP1Q96JM3 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CHAMP1Q96JM3 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CHAMP1Q96JM3 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CHAMP1Q96JM3 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CHAMP1Q96JM3 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CHAMP1Q96JM3 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CHAMP1Q96JM3 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CHAMP1Q96JM3 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CHAMP1Q96JM3 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CHAMP1Q96JM3 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CHAMP1Q96JM3 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CHAMP1Q96JM3 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CHAMP1Q96JM3 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CHAMP1Q96JM3 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CHAMP1Q96JM3 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CHAMP1Q96JM3 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CHAMP1Q96JM3 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CHAMP1Q96JM3 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CHAMP1Q96JM3 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CHAMP1Q96JM3 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CHAMP1Q96JM3 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CHAMP1Q96JM3 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CHAMP1Q96JM3 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CHAMP1Q96JM3 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CHAMP1Q96JM3 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CHAMP1Q96JM3 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CHAMP1Q96JM3 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
CHAMP1Q96JM3 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CHAMP1Q96JM3 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CHAMP1Q96JM3 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CHAMP1Q96JM3 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CHAMP1Q96JM3 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CHAMP1Q96JM3 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CHAMP1Q96JM3 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CHAMP1Q96JM3 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CHAMP1Q96JM3 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CHAMP1Q96JM3 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CHAMP1Q96JM3 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CHAMP1Q96JM3 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CHAMP1Q96JM3 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CHAMP1Q96JM3 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHAMP1Q96JM3 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHAMP1Q96JM3 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHAMP1Q96JM3 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHAMP1Q96JM3 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHAMP1Q96JM3 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHAMP1Q96JM3 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHAMP1Q96JM3 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHAMP1Q96JM3 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CHAMP1Q96JM3 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CHAMP1Q96JM3 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CHAMP1Q96JM3 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CHAMP1Q96JM3 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CHAMP1Q96JM3 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CHAMP1Q96JM3 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CHAMP1Q96JM3 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms