Protein–RNA interactions for Protein: Q96JA1

LRIG1, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG1Q96JA1 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRIG1Q96JA1 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRIG1Q96JA1 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRIG1Q96JA1 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRIG1Q96JA1 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRIG1Q96JA1 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRIG1Q96JA1 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRIG1Q96JA1 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRIG1Q96JA1 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRIG1Q96JA1 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
LRIG1Q96JA1 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRIG1Q96JA1 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRIG1Q96JA1 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRIG1Q96JA1 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRIG1Q96JA1 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRIG1Q96JA1 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRIG1Q96JA1 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRIG1Q96JA1 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRIG1Q96JA1 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRIG1Q96JA1 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRIG1Q96JA1 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRIG1Q96JA1 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRIG1Q96JA1 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRIG1Q96JA1 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRIG1Q96JA1 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRIG1Q96JA1 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRIG1Q96JA1 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
LRIG1Q96JA1 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRIG1Q96JA1 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRIG1Q96JA1 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRIG1Q96JA1 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRIG1Q96JA1 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRIG1Q96JA1 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRIG1Q96JA1 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRIG1Q96JA1 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRIG1Q96JA1 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRIG1Q96JA1 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRIG1Q96JA1 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRIG1Q96JA1 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRIG1Q96JA1 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRIG1Q96JA1 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
LRIG1Q96JA1 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRIG1Q96JA1 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRIG1Q96JA1 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRIG1Q96JA1 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRIG1Q96JA1 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRIG1Q96JA1 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRIG1Q96JA1 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRIG1Q96JA1 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRIG1Q96JA1 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRIG1Q96JA1 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRIG1Q96JA1 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRIG1Q96JA1 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRIG1Q96JA1 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRIG1Q96JA1 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LRIG1Q96JA1 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRIG1Q96JA1 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRIG1Q96JA1 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRIG1Q96JA1 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRIG1Q96JA1 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRIG1Q96JA1 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
LRIG1Q96JA1 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRIG1Q96JA1 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRIG1Q96JA1 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRIG1Q96JA1 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRIG1Q96JA1 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRIG1Q96JA1 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRIG1Q96JA1 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRIG1Q96JA1 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRIG1Q96JA1 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRIG1Q96JA1 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRIG1Q96JA1 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRIG1Q96JA1 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRIG1Q96JA1 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRIG1Q96JA1 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
LRIG1Q96JA1 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRIG1Q96JA1 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRIG1Q96JA1 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRIG1Q96JA1 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRIG1Q96JA1 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
LRIG1Q96JA1 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRIG1Q96JA1 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRIG1Q96JA1 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRIG1Q96JA1 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRIG1Q96JA1 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
LRIG1Q96JA1 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRIG1Q96JA1 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRIG1Q96JA1 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRIG1Q96JA1 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRIG1Q96JA1 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRIG1Q96JA1 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRIG1Q96JA1 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRIG1Q96JA1 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRIG1Q96JA1 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRIG1Q96JA1 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
LRIG1Q96JA1 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRIG1Q96JA1 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRIG1Q96JA1 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRIG1Q96JA1 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRIG1Q96JA1 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms