Protein–RNA interactions for Protein: Q96I25

RBM17, Splicing factor 45, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM17Q96I25 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RBM17Q96I25 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RBM17Q96I25 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RBM17Q96I25 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
RBM17Q96I25 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RBM17Q96I25 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RBM17Q96I25 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
RBM17Q96I25 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RBM17Q96I25 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RBM17Q96I25 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RBM17Q96I25 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RBM17Q96I25 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RBM17Q96I25 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RBM17Q96I25 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RBM17Q96I25 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RBM17Q96I25 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RBM17Q96I25 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
RBM17Q96I25 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RBM17Q96I25 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RBM17Q96I25 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RBM17Q96I25 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RBM17Q96I25 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RBM17Q96I25 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
RBM17Q96I25 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RBM17Q96I25 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RBM17Q96I25 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
RBM17Q96I25 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RBM17Q96I25 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RBM17Q96I25 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
RBM17Q96I25 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RBM17Q96I25 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RBM17Q96I25 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RBM17Q96I25 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RBM17Q96I25 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RBM17Q96I25 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RBM17Q96I25 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RBM17Q96I25 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RBM17Q96I25 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RBM17Q96I25 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RBM17Q96I25 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RBM17Q96I25 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RBM17Q96I25 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RBM17Q96I25 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RBM17Q96I25 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RBM17Q96I25 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RBM17Q96I25 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
RBM17Q96I25 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RBM17Q96I25 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
RBM17Q96I25 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
RBM17Q96I25 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RBM17Q96I25 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RBM17Q96I25 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RBM17Q96I25 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RBM17Q96I25 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RBM17Q96I25 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RBM17Q96I25 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RBM17Q96I25 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RBM17Q96I25 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RBM17Q96I25 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RBM17Q96I25 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RBM17Q96I25 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RBM17Q96I25 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RBM17Q96I25 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RBM17Q96I25 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
RBM17Q96I25 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RBM17Q96I25 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RBM17Q96I25 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RBM17Q96I25 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RBM17Q96I25 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
RBM17Q96I25 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RBM17Q96I25 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RBM17Q96I25 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RBM17Q96I25 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RBM17Q96I25 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RBM17Q96I25 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RBM17Q96I25 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RBM17Q96I25 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RBM17Q96I25 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
RBM17Q96I25 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RBM17Q96I25 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RBM17Q96I25 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RBM17Q96I25 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RBM17Q96I25 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RBM17Q96I25 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RBM17Q96I25 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RBM17Q96I25 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
RBM17Q96I25 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RBM17Q96I25 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RBM17Q96I25 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RBM17Q96I25 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RBM17Q96I25 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RBM17Q96I25 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
RBM17Q96I25 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RBM17Q96I25 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RBM17Q96I25 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RBM17Q96I25 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RBM17Q96I25 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
RBM17Q96I25 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RBM17Q96I25 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
RBM17Q96I25 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms