Protein–RNA interactions for Protein: Q96HU1

SGSM3, Small G protein signaling modulator 3, humanhuman

Predictions only

Length 749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM3Q96HU1 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SGSM3Q96HU1 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SGSM3Q96HU1 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SGSM3Q96HU1 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SGSM3Q96HU1 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SGSM3Q96HU1 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SGSM3Q96HU1 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SGSM3Q96HU1 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SGSM3Q96HU1 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SGSM3Q96HU1 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SGSM3Q96HU1 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SGSM3Q96HU1 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SGSM3Q96HU1 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SGSM3Q96HU1 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SGSM3Q96HU1 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SGSM3Q96HU1 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SGSM3Q96HU1 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SGSM3Q96HU1 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SGSM3Q96HU1 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SGSM3Q96HU1 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SGSM3Q96HU1 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SGSM3Q96HU1 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SGSM3Q96HU1 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SGSM3Q96HU1 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SGSM3Q96HU1 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SGSM3Q96HU1 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SGSM3Q96HU1 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SGSM3Q96HU1 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SGSM3Q96HU1 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SGSM3Q96HU1 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SGSM3Q96HU1 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SGSM3Q96HU1 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SGSM3Q96HU1 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SGSM3Q96HU1 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SGSM3Q96HU1 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SGSM3Q96HU1 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SGSM3Q96HU1 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SGSM3Q96HU1 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SGSM3Q96HU1 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SGSM3Q96HU1 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SGSM3Q96HU1 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
SGSM3Q96HU1 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
SGSM3Q96HU1 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SGSM3Q96HU1 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SGSM3Q96HU1 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SGSM3Q96HU1 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SGSM3Q96HU1 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SGSM3Q96HU1 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SGSM3Q96HU1 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SGSM3Q96HU1 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SGSM3Q96HU1 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SGSM3Q96HU1 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SGSM3Q96HU1 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SGSM3Q96HU1 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SGSM3Q96HU1 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SGSM3Q96HU1 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SGSM3Q96HU1 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SGSM3Q96HU1 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SGSM3Q96HU1 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SGSM3Q96HU1 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SGSM3Q96HU1 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SGSM3Q96HU1 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SGSM3Q96HU1 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SGSM3Q96HU1 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SGSM3Q96HU1 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SGSM3Q96HU1 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SGSM3Q96HU1 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SGSM3Q96HU1 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SGSM3Q96HU1 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SGSM3Q96HU1 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SGSM3Q96HU1 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SGSM3Q96HU1 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SGSM3Q96HU1 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SGSM3Q96HU1 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SGSM3Q96HU1 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SGSM3Q96HU1 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SGSM3Q96HU1 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SGSM3Q96HU1 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SGSM3Q96HU1 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SGSM3Q96HU1 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SGSM3Q96HU1 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SGSM3Q96HU1 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SGSM3Q96HU1 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SGSM3Q96HU1 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SGSM3Q96HU1 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SGSM3Q96HU1 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SGSM3Q96HU1 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SGSM3Q96HU1 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SGSM3Q96HU1 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SGSM3Q96HU1 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SGSM3Q96HU1 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SGSM3Q96HU1 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SGSM3Q96HU1 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SGSM3Q96HU1 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SGSM3Q96HU1 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SGSM3Q96HU1 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SGSM3Q96HU1 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SGSM3Q96HU1 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SGSM3Q96HU1 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SGSM3Q96HU1 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.7 ms