Protein–RNA interactions for Protein: Q96GD3

SCMH1, Polycomb protein SCMH1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCMH1Q96GD3 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SCMH1Q96GD3 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SCMH1Q96GD3 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SCMH1Q96GD3 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SCMH1Q96GD3 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SCMH1Q96GD3 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SCMH1Q96GD3 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SCMH1Q96GD3 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SCMH1Q96GD3 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SCMH1Q96GD3 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SCMH1Q96GD3 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SCMH1Q96GD3 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SCMH1Q96GD3 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SCMH1Q96GD3 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SCMH1Q96GD3 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SCMH1Q96GD3 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SCMH1Q96GD3 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SCMH1Q96GD3 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SCMH1Q96GD3 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SCMH1Q96GD3 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SCMH1Q96GD3 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SCMH1Q96GD3 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SCMH1Q96GD3 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SCMH1Q96GD3 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SCMH1Q96GD3 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SCMH1Q96GD3 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SCMH1Q96GD3 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SCMH1Q96GD3 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SCMH1Q96GD3 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SCMH1Q96GD3 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SCMH1Q96GD3 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SCMH1Q96GD3 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SCMH1Q96GD3 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SCMH1Q96GD3 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SCMH1Q96GD3 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SCMH1Q96GD3 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SCMH1Q96GD3 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SCMH1Q96GD3 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SCMH1Q96GD3 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SCMH1Q96GD3 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SCMH1Q96GD3 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SCMH1Q96GD3 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SCMH1Q96GD3 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SCMH1Q96GD3 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SCMH1Q96GD3 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
SCMH1Q96GD3 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SCMH1Q96GD3 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SCMH1Q96GD3 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SCMH1Q96GD3 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SCMH1Q96GD3 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SCMH1Q96GD3 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SCMH1Q96GD3 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SCMH1Q96GD3 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SCMH1Q96GD3 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SCMH1Q96GD3 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SCMH1Q96GD3 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SCMH1Q96GD3 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SCMH1Q96GD3 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SCMH1Q96GD3 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SCMH1Q96GD3 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SCMH1Q96GD3 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SCMH1Q96GD3 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SCMH1Q96GD3 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SCMH1Q96GD3 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SCMH1Q96GD3 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SCMH1Q96GD3 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SCMH1Q96GD3 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SCMH1Q96GD3 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SCMH1Q96GD3 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SCMH1Q96GD3 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SCMH1Q96GD3 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SCMH1Q96GD3 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SCMH1Q96GD3 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SCMH1Q96GD3 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SCMH1Q96GD3 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SCMH1Q96GD3 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SCMH1Q96GD3 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
SCMH1Q96GD3 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SCMH1Q96GD3 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SCMH1Q96GD3 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SCMH1Q96GD3 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SCMH1Q96GD3 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SCMH1Q96GD3 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SCMH1Q96GD3 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SCMH1Q96GD3 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SCMH1Q96GD3 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SCMH1Q96GD3 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SCMH1Q96GD3 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
SCMH1Q96GD3 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SCMH1Q96GD3 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SCMH1Q96GD3 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SCMH1Q96GD3 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SCMH1Q96GD3 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SCMH1Q96GD3 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SCMH1Q96GD3 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SCMH1Q96GD3 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SCMH1Q96GD3 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SCMH1Q96GD3 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SCMH1Q96GD3 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SCMH1Q96GD3 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms