Protein–RNA interactions for Protein: Q96ET8

TVP23C, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog C, humanhuman

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TVP23CQ96ET8 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TVP23CQ96ET8 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TVP23CQ96ET8 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TVP23CQ96ET8 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TVP23CQ96ET8 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TVP23CQ96ET8 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TVP23CQ96ET8 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TVP23CQ96ET8 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TVP23CQ96ET8 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TVP23CQ96ET8 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TVP23CQ96ET8 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TVP23CQ96ET8 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TVP23CQ96ET8 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TVP23CQ96ET8 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TVP23CQ96ET8 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TVP23CQ96ET8 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TVP23CQ96ET8 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TVP23CQ96ET8 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TVP23CQ96ET8 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TVP23CQ96ET8 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TVP23CQ96ET8 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TVP23CQ96ET8 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TVP23CQ96ET8 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TVP23CQ96ET8 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TVP23CQ96ET8 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TVP23CQ96ET8 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TVP23CQ96ET8 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TVP23CQ96ET8 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TVP23CQ96ET8 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TVP23CQ96ET8 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TVP23CQ96ET8 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TVP23CQ96ET8 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TVP23CQ96ET8 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TVP23CQ96ET8 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TVP23CQ96ET8 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TVP23CQ96ET8 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
TVP23CQ96ET8 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TVP23CQ96ET8 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TVP23CQ96ET8 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TVP23CQ96ET8 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TVP23CQ96ET8 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TVP23CQ96ET8 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TVP23CQ96ET8 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TVP23CQ96ET8 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TVP23CQ96ET8 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TVP23CQ96ET8 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TVP23CQ96ET8 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TVP23CQ96ET8 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TVP23CQ96ET8 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TVP23CQ96ET8 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TVP23CQ96ET8 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TVP23CQ96ET8 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TVP23CQ96ET8 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TVP23CQ96ET8 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TVP23CQ96ET8 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TVP23CQ96ET8 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TVP23CQ96ET8 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TVP23CQ96ET8 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TVP23CQ96ET8 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TVP23CQ96ET8 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TVP23CQ96ET8 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TVP23CQ96ET8 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TVP23CQ96ET8 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TVP23CQ96ET8 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TVP23CQ96ET8 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TVP23CQ96ET8 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TVP23CQ96ET8 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TVP23CQ96ET8 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TVP23CQ96ET8 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TVP23CQ96ET8 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TVP23CQ96ET8 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TVP23CQ96ET8 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TVP23CQ96ET8 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TVP23CQ96ET8 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TVP23CQ96ET8 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
TVP23CQ96ET8 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TVP23CQ96ET8 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TVP23CQ96ET8 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TVP23CQ96ET8 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TVP23CQ96ET8 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TVP23CQ96ET8 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TVP23CQ96ET8 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TVP23CQ96ET8 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TVP23CQ96ET8 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
TVP23CQ96ET8 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TVP23CQ96ET8 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TVP23CQ96ET8 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TVP23CQ96ET8 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TVP23CQ96ET8 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TVP23CQ96ET8 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TVP23CQ96ET8 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TVP23CQ96ET8 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TVP23CQ96ET8 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TVP23CQ96ET8 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TVP23CQ96ET8 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TVP23CQ96ET8 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TVP23CQ96ET8 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TVP23CQ96ET8 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TVP23CQ96ET8 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TVP23CQ96ET8 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms