Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES7

SGF29, SAGA-associated factor 29, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGF29Q96ES7 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SGF29Q96ES7 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SGF29Q96ES7 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SGF29Q96ES7 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SGF29Q96ES7 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SGF29Q96ES7 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SGF29Q96ES7 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SGF29Q96ES7 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SGF29Q96ES7 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SGF29Q96ES7 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SGF29Q96ES7 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SGF29Q96ES7 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SGF29Q96ES7 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SGF29Q96ES7 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SGF29Q96ES7 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SGF29Q96ES7 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SGF29Q96ES7 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SGF29Q96ES7 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SGF29Q96ES7 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SGF29Q96ES7 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SGF29Q96ES7 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SGF29Q96ES7 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SGF29Q96ES7 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SGF29Q96ES7 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
SGF29Q96ES7 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SGF29Q96ES7 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SGF29Q96ES7 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SGF29Q96ES7 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SGF29Q96ES7 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SGF29Q96ES7 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SGF29Q96ES7 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SGF29Q96ES7 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SGF29Q96ES7 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SGF29Q96ES7 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SGF29Q96ES7 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SGF29Q96ES7 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SGF29Q96ES7 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SGF29Q96ES7 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SGF29Q96ES7 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SGF29Q96ES7 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SGF29Q96ES7 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SGF29Q96ES7 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SGF29Q96ES7 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SGF29Q96ES7 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SGF29Q96ES7 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SGF29Q96ES7 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SGF29Q96ES7 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SGF29Q96ES7 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SGF29Q96ES7 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SGF29Q96ES7 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SGF29Q96ES7 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SGF29Q96ES7 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SGF29Q96ES7 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SGF29Q96ES7 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SGF29Q96ES7 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SGF29Q96ES7 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SGF29Q96ES7 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SGF29Q96ES7 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SGF29Q96ES7 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SGF29Q96ES7 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SGF29Q96ES7 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SGF29Q96ES7 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SGF29Q96ES7 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SGF29Q96ES7 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SGF29Q96ES7 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SGF29Q96ES7 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SGF29Q96ES7 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SGF29Q96ES7 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SGF29Q96ES7 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SGF29Q96ES7 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SGF29Q96ES7 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SGF29Q96ES7 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SGF29Q96ES7 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SGF29Q96ES7 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SGF29Q96ES7 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SGF29Q96ES7 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SGF29Q96ES7 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SGF29Q96ES7 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SGF29Q96ES7 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SGF29Q96ES7 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SGF29Q96ES7 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SGF29Q96ES7 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SGF29Q96ES7 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SGF29Q96ES7 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SGF29Q96ES7 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SGF29Q96ES7 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SGF29Q96ES7 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SGF29Q96ES7 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SGF29Q96ES7 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SGF29Q96ES7 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SGF29Q96ES7 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SGF29Q96ES7 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SGF29Q96ES7 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SGF29Q96ES7 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SGF29Q96ES7 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SGF29Q96ES7 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SGF29Q96ES7 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SGF29Q96ES7 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SGF29Q96ES7 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SGF29Q96ES7 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms