Protein–RNA interactions for Protein: Q96ER9

CCDC51, Coiled-coil domain-containing protein 51, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC51Q96ER9 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC51Q96ER9 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC51Q96ER9 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC51Q96ER9 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC51Q96ER9 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC51Q96ER9 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC51Q96ER9 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC51Q96ER9 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC51Q96ER9 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC51Q96ER9 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC51Q96ER9 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC51Q96ER9 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC51Q96ER9 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC51Q96ER9 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC51Q96ER9 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC51Q96ER9 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC51Q96ER9 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC51Q96ER9 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC51Q96ER9 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC51Q96ER9 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC51Q96ER9 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC51Q96ER9 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC51Q96ER9 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC51Q96ER9 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC51Q96ER9 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC51Q96ER9 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC51Q96ER9 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC51Q96ER9 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC51Q96ER9 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC51Q96ER9 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CCDC51Q96ER9 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CCDC51Q96ER9 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CCDC51Q96ER9 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CCDC51Q96ER9 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CCDC51Q96ER9 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CCDC51Q96ER9 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CCDC51Q96ER9 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CCDC51Q96ER9 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC51Q96ER9 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC51Q96ER9 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC51Q96ER9 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC51Q96ER9 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC51Q96ER9 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC51Q96ER9 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC51Q96ER9 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC51Q96ER9 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC51Q96ER9 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC51Q96ER9 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC51Q96ER9 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC51Q96ER9 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC51Q96ER9 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC51Q96ER9 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC51Q96ER9 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC51Q96ER9 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC51Q96ER9 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC51Q96ER9 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC51Q96ER9 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC51Q96ER9 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC51Q96ER9 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC51Q96ER9 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC51Q96ER9 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC51Q96ER9 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC51Q96ER9 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC51Q96ER9 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC51Q96ER9 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC51Q96ER9 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC51Q96ER9 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC51Q96ER9 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC51Q96ER9 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC51Q96ER9 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC51Q96ER9 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC51Q96ER9 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC51Q96ER9 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC51Q96ER9 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC51Q96ER9 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC51Q96ER9 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC51Q96ER9 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC51Q96ER9 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC51Q96ER9 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC51Q96ER9 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC51Q96ER9 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC51Q96ER9 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC51Q96ER9 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC51Q96ER9 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC51Q96ER9 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC51Q96ER9 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC51Q96ER9 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC51Q96ER9 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC51Q96ER9 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC51Q96ER9 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC51Q96ER9 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC51Q96ER9 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC51Q96ER9 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC51Q96ER9 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC51Q96ER9 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC51Q96ER9 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC51Q96ER9 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC51Q96ER9 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC51Q96ER9 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC51Q96ER9 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms