Protein–RNA interactions for Protein: Q96CW5

TUBGCP3, Gamma-tubulin complex component 3, humanhuman

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBGCP3Q96CW5 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TUBGCP3Q96CW5 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TUBGCP3Q96CW5 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TUBGCP3Q96CW5 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TUBGCP3Q96CW5 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
TUBGCP3Q96CW5 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TUBGCP3Q96CW5 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TUBGCP3Q96CW5 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TUBGCP3Q96CW5 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TUBGCP3Q96CW5 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TUBGCP3Q96CW5 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TUBGCP3Q96CW5 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TUBGCP3Q96CW5 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TUBGCP3Q96CW5 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
TUBGCP3Q96CW5 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TUBGCP3Q96CW5 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TUBGCP3Q96CW5 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TUBGCP3Q96CW5 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TUBGCP3Q96CW5 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TUBGCP3Q96CW5 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TUBGCP3Q96CW5 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TUBGCP3Q96CW5 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TUBGCP3Q96CW5 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TUBGCP3Q96CW5 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TUBGCP3Q96CW5 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TUBGCP3Q96CW5 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TUBGCP3Q96CW5 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TUBGCP3Q96CW5 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TUBGCP3Q96CW5 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TUBGCP3Q96CW5 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TUBGCP3Q96CW5 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TUBGCP3Q96CW5 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TUBGCP3Q96CW5 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TUBGCP3Q96CW5 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TUBGCP3Q96CW5 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TUBGCP3Q96CW5 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
TUBGCP3Q96CW5 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TUBGCP3Q96CW5 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TUBGCP3Q96CW5 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TUBGCP3Q96CW5 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TUBGCP3Q96CW5 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TUBGCP3Q96CW5 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TUBGCP3Q96CW5 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TUBGCP3Q96CW5 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TUBGCP3Q96CW5 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TUBGCP3Q96CW5 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TUBGCP3Q96CW5 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
TUBGCP3Q96CW5 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TUBGCP3Q96CW5 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TUBGCP3Q96CW5 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TUBGCP3Q96CW5 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TUBGCP3Q96CW5 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TUBGCP3Q96CW5 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TUBGCP3Q96CW5 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TUBGCP3Q96CW5 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TUBGCP3Q96CW5 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TUBGCP3Q96CW5 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TUBGCP3Q96CW5 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TUBGCP3Q96CW5 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TUBGCP3Q96CW5 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TUBGCP3Q96CW5 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TUBGCP3Q96CW5 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TUBGCP3Q96CW5 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TUBGCP3Q96CW5 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TUBGCP3Q96CW5 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TUBGCP3Q96CW5 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TUBGCP3Q96CW5 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TUBGCP3Q96CW5 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TUBGCP3Q96CW5 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TUBGCP3Q96CW5 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TUBGCP3Q96CW5 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TUBGCP3Q96CW5 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TUBGCP3Q96CW5 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TUBGCP3Q96CW5 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TUBGCP3Q96CW5 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
TUBGCP3Q96CW5 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
TUBGCP3Q96CW5 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TUBGCP3Q96CW5 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TUBGCP3Q96CW5 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TUBGCP3Q96CW5 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TUBGCP3Q96CW5 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TUBGCP3Q96CW5 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TUBGCP3Q96CW5 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TUBGCP3Q96CW5 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TUBGCP3Q96CW5 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TUBGCP3Q96CW5 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TUBGCP3Q96CW5 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TUBGCP3Q96CW5 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TUBGCP3Q96CW5 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TUBGCP3Q96CW5 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TUBGCP3Q96CW5 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TUBGCP3Q96CW5 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TUBGCP3Q96CW5 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TUBGCP3Q96CW5 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TUBGCP3Q96CW5 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TUBGCP3Q96CW5 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TUBGCP3Q96CW5 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TUBGCP3Q96CW5 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TUBGCP3Q96CW5 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TUBGCP3Q96CW5 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms