Protein–RNA interactions for Protein: Q96CP6

GRAMD1A, GRAM domain-containing protein 1A, humanhuman

Predictions only

Length 724 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRAMD1AQ96CP6 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GRAMD1AQ96CP6 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GRAMD1AQ96CP6 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GRAMD1AQ96CP6 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
GRAMD1AQ96CP6 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GRAMD1AQ96CP6 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GRAMD1AQ96CP6 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GRAMD1AQ96CP6 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GRAMD1AQ96CP6 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GRAMD1AQ96CP6 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GRAMD1AQ96CP6 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GRAMD1AQ96CP6 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
GRAMD1AQ96CP6 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GRAMD1AQ96CP6 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GRAMD1AQ96CP6 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GRAMD1AQ96CP6 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GRAMD1AQ96CP6 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GRAMD1AQ96CP6 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GRAMD1AQ96CP6 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GRAMD1AQ96CP6 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GRAMD1AQ96CP6 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GRAMD1AQ96CP6 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GRAMD1AQ96CP6 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GRAMD1AQ96CP6 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GRAMD1AQ96CP6 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GRAMD1AQ96CP6 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GRAMD1AQ96CP6 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GRAMD1AQ96CP6 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GRAMD1AQ96CP6 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GRAMD1AQ96CP6 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GRAMD1AQ96CP6 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GRAMD1AQ96CP6 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GRAMD1AQ96CP6 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GRAMD1AQ96CP6 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GRAMD1AQ96CP6 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GRAMD1AQ96CP6 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GRAMD1AQ96CP6 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GRAMD1AQ96CP6 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GRAMD1AQ96CP6 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GRAMD1AQ96CP6 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GRAMD1AQ96CP6 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GRAMD1AQ96CP6 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GRAMD1AQ96CP6 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GRAMD1AQ96CP6 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GRAMD1AQ96CP6 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GRAMD1AQ96CP6 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
GRAMD1AQ96CP6 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GRAMD1AQ96CP6 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GRAMD1AQ96CP6 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GRAMD1AQ96CP6 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GRAMD1AQ96CP6 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GRAMD1AQ96CP6 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GRAMD1AQ96CP6 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GRAMD1AQ96CP6 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GRAMD1AQ96CP6 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GRAMD1AQ96CP6 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GRAMD1AQ96CP6 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
GRAMD1AQ96CP6 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GRAMD1AQ96CP6 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GRAMD1AQ96CP6 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GRAMD1AQ96CP6 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
GRAMD1AQ96CP6 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GRAMD1AQ96CP6 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
GRAMD1AQ96CP6 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GRAMD1AQ96CP6 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GRAMD1AQ96CP6 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GRAMD1AQ96CP6 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GRAMD1AQ96CP6 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GRAMD1AQ96CP6 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GRAMD1AQ96CP6 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GRAMD1AQ96CP6 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GRAMD1AQ96CP6 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GRAMD1AQ96CP6 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GRAMD1AQ96CP6 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GRAMD1AQ96CP6 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GRAMD1AQ96CP6 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GRAMD1AQ96CP6 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GRAMD1AQ96CP6 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GRAMD1AQ96CP6 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GRAMD1AQ96CP6 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
GRAMD1AQ96CP6 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GRAMD1AQ96CP6 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GRAMD1AQ96CP6 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GRAMD1AQ96CP6 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GRAMD1AQ96CP6 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GRAMD1AQ96CP6 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GRAMD1AQ96CP6 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GRAMD1AQ96CP6 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRAMD1AQ96CP6 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRAMD1AQ96CP6 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRAMD1AQ96CP6 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRAMD1AQ96CP6 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRAMD1AQ96CP6 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRAMD1AQ96CP6 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRAMD1AQ96CP6 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRAMD1AQ96CP6 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRAMD1AQ96CP6 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRAMD1AQ96CP6 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
GRAMD1AQ96CP6 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
GRAMD1AQ96CP6 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms