Protein–RNA interactions for Protein: Q96CN9

GCC1, GRIP and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCC1Q96CN9 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
GCC1Q96CN9 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GCC1Q96CN9 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GCC1Q96CN9 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
GCC1Q96CN9 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
GCC1Q96CN9 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
GCC1Q96CN9 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
GCC1Q96CN9 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
GCC1Q96CN9 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GCC1Q96CN9 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GCC1Q96CN9 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GCC1Q96CN9 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GCC1Q96CN9 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GCC1Q96CN9 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GCC1Q96CN9 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
GCC1Q96CN9 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
GCC1Q96CN9 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
GCC1Q96CN9 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
GCC1Q96CN9 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
GCC1Q96CN9 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
GCC1Q96CN9 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
GCC1Q96CN9 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
GCC1Q96CN9 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
GCC1Q96CN9 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GCC1Q96CN9 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
GCC1Q96CN9 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GCC1Q96CN9 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
GCC1Q96CN9 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GCC1Q96CN9 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
GCC1Q96CN9 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GCC1Q96CN9 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GCC1Q96CN9 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
GCC1Q96CN9 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GCC1Q96CN9 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GCC1Q96CN9 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
GCC1Q96CN9 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
GCC1Q96CN9 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
GCC1Q96CN9 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
GCC1Q96CN9 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
GCC1Q96CN9 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GCC1Q96CN9 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
GCC1Q96CN9 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
GCC1Q96CN9 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
GCC1Q96CN9 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
GCC1Q96CN9 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
GCC1Q96CN9 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
GCC1Q96CN9 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
GCC1Q96CN9 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
GCC1Q96CN9 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
GCC1Q96CN9 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
GCC1Q96CN9 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
GCC1Q96CN9 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
GCC1Q96CN9 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
GCC1Q96CN9 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
GCC1Q96CN9 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
GCC1Q96CN9 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
GCC1Q96CN9 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
GCC1Q96CN9 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
GCC1Q96CN9 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
GCC1Q96CN9 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GCC1Q96CN9 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
GCC1Q96CN9 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
GCC1Q96CN9 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
GCC1Q96CN9 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GCC1Q96CN9 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
GCC1Q96CN9 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GCC1Q96CN9 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GCC1Q96CN9 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
GCC1Q96CN9 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
GCC1Q96CN9 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GCC1Q96CN9 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GCC1Q96CN9 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
GCC1Q96CN9 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GCC1Q96CN9 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
GCC1Q96CN9 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
GCC1Q96CN9 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GCC1Q96CN9 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GCC1Q96CN9 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
GCC1Q96CN9 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GCC1Q96CN9 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
GCC1Q96CN9 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
GCC1Q96CN9 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
GCC1Q96CN9 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
GCC1Q96CN9 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC27.36■■□□□ 1.97
GCC1Q96CN9 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
GCC1Q96CN9 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
GCC1Q96CN9 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
GCC1Q96CN9 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
GCC1Q96CN9 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
GCC1Q96CN9 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GCC1Q96CN9 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
GCC1Q96CN9 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GCC1Q96CN9 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
GCC1Q96CN9 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
GCC1Q96CN9 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
GCC1Q96CN9 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
GCC1Q96CN9 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
GCC1Q96CN9 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
GCC1Q96CN9 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
GCC1Q96CN9 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms