Protein–RNA interactions for Protein: Q96CJ1

EAF2, ELL-associated factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EAF2Q96CJ1 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
EAF2Q96CJ1 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
EAF2Q96CJ1 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
EAF2Q96CJ1 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
EAF2Q96CJ1 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
EAF2Q96CJ1 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
EAF2Q96CJ1 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
EAF2Q96CJ1 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
EAF2Q96CJ1 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
EAF2Q96CJ1 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
EAF2Q96CJ1 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
EAF2Q96CJ1 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
EAF2Q96CJ1 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
EAF2Q96CJ1 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
EAF2Q96CJ1 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
EAF2Q96CJ1 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
EAF2Q96CJ1 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
EAF2Q96CJ1 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
EAF2Q96CJ1 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
EAF2Q96CJ1 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
EAF2Q96CJ1 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
EAF2Q96CJ1 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
EAF2Q96CJ1 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
EAF2Q96CJ1 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
EAF2Q96CJ1 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
EAF2Q96CJ1 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
EAF2Q96CJ1 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
EAF2Q96CJ1 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
EAF2Q96CJ1 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
EAF2Q96CJ1 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
EAF2Q96CJ1 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
EAF2Q96CJ1 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
EAF2Q96CJ1 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
EAF2Q96CJ1 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
EAF2Q96CJ1 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
EAF2Q96CJ1 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
EAF2Q96CJ1 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
EAF2Q96CJ1 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
EAF2Q96CJ1 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
EAF2Q96CJ1 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
EAF2Q96CJ1 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
EAF2Q96CJ1 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
EAF2Q96CJ1 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
EAF2Q96CJ1 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
EAF2Q96CJ1 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
EAF2Q96CJ1 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
EAF2Q96CJ1 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
EAF2Q96CJ1 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
EAF2Q96CJ1 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
EAF2Q96CJ1 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
EAF2Q96CJ1 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
EAF2Q96CJ1 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
EAF2Q96CJ1 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
EAF2Q96CJ1 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
EAF2Q96CJ1 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
EAF2Q96CJ1 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
EAF2Q96CJ1 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
EAF2Q96CJ1 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
EAF2Q96CJ1 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
EAF2Q96CJ1 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
EAF2Q96CJ1 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
EAF2Q96CJ1 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
EAF2Q96CJ1 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
EAF2Q96CJ1 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
EAF2Q96CJ1 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
EAF2Q96CJ1 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
EAF2Q96CJ1 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
EAF2Q96CJ1 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
EAF2Q96CJ1 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
EAF2Q96CJ1 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
EAF2Q96CJ1 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
EAF2Q96CJ1 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
EAF2Q96CJ1 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
EAF2Q96CJ1 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
EAF2Q96CJ1 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
EAF2Q96CJ1 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
EAF2Q96CJ1 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
EAF2Q96CJ1 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
EAF2Q96CJ1 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
EAF2Q96CJ1 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
EAF2Q96CJ1 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
EAF2Q96CJ1 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
EAF2Q96CJ1 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
EAF2Q96CJ1 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
EAF2Q96CJ1 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
EAF2Q96CJ1 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
EAF2Q96CJ1 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
EAF2Q96CJ1 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
EAF2Q96CJ1 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
EAF2Q96CJ1 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
EAF2Q96CJ1 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
EAF2Q96CJ1 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
EAF2Q96CJ1 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
EAF2Q96CJ1 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
EAF2Q96CJ1 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
EAF2Q96CJ1 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
EAF2Q96CJ1 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
EAF2Q96CJ1 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
EAF2Q96CJ1 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
EAF2Q96CJ1 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms