Protein–RNA interactions for Protein: Q96CC6

RHBDF1, Inactive rhomboid protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDF1Q96CC6 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RHBDF1Q96CC6 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RHBDF1Q96CC6 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RHBDF1Q96CC6 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RHBDF1Q96CC6 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RHBDF1Q96CC6 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RHBDF1Q96CC6 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RHBDF1Q96CC6 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RHBDF1Q96CC6 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RHBDF1Q96CC6 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RHBDF1Q96CC6 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RHBDF1Q96CC6 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RHBDF1Q96CC6 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
RHBDF1Q96CC6 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RHBDF1Q96CC6 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RHBDF1Q96CC6 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RHBDF1Q96CC6 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RHBDF1Q96CC6 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RHBDF1Q96CC6 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RHBDF1Q96CC6 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RHBDF1Q96CC6 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RHBDF1Q96CC6 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RHBDF1Q96CC6 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RHBDF1Q96CC6 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RHBDF1Q96CC6 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RHBDF1Q96CC6 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RHBDF1Q96CC6 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RHBDF1Q96CC6 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RHBDF1Q96CC6 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RHBDF1Q96CC6 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RHBDF1Q96CC6 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RHBDF1Q96CC6 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RHBDF1Q96CC6 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
RHBDF1Q96CC6 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RHBDF1Q96CC6 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RHBDF1Q96CC6 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
RHBDF1Q96CC6 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RHBDF1Q96CC6 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RHBDF1Q96CC6 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RHBDF1Q96CC6 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
RHBDF1Q96CC6 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
RHBDF1Q96CC6 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RHBDF1Q96CC6 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
RHBDF1Q96CC6 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
RHBDF1Q96CC6 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RHBDF1Q96CC6 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RHBDF1Q96CC6 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RHBDF1Q96CC6 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RHBDF1Q96CC6 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RHBDF1Q96CC6 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RHBDF1Q96CC6 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RHBDF1Q96CC6 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RHBDF1Q96CC6 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RHBDF1Q96CC6 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RHBDF1Q96CC6 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RHBDF1Q96CC6 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RHBDF1Q96CC6 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RHBDF1Q96CC6 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RHBDF1Q96CC6 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RHBDF1Q96CC6 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RHBDF1Q96CC6 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RHBDF1Q96CC6 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
RHBDF1Q96CC6 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RHBDF1Q96CC6 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RHBDF1Q96CC6 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RHBDF1Q96CC6 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RHBDF1Q96CC6 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RHBDF1Q96CC6 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RHBDF1Q96CC6 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RHBDF1Q96CC6 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
RHBDF1Q96CC6 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RHBDF1Q96CC6 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RHBDF1Q96CC6 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RHBDF1Q96CC6 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RHBDF1Q96CC6 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RHBDF1Q96CC6 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RHBDF1Q96CC6 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RHBDF1Q96CC6 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RHBDF1Q96CC6 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RHBDF1Q96CC6 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RHBDF1Q96CC6 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RHBDF1Q96CC6 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RHBDF1Q96CC6 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RHBDF1Q96CC6 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RHBDF1Q96CC6 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RHBDF1Q96CC6 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RHBDF1Q96CC6 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RHBDF1Q96CC6 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RHBDF1Q96CC6 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RHBDF1Q96CC6 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RHBDF1Q96CC6 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RHBDF1Q96CC6 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RHBDF1Q96CC6 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
RHBDF1Q96CC6 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RHBDF1Q96CC6 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RHBDF1Q96CC6 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RHBDF1Q96CC6 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RHBDF1Q96CC6 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RHBDF1Q96CC6 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RHBDF1Q96CC6 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms