Protein–RNA interactions for Protein: Q969P6

TOP1MT, DNA topoisomerase I, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP1MTQ969P6 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TOP1MTQ969P6 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TOP1MTQ969P6 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TOP1MTQ969P6 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
TOP1MTQ969P6 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TOP1MTQ969P6 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TOP1MTQ969P6 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TOP1MTQ969P6 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
TOP1MTQ969P6 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TOP1MTQ969P6 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TOP1MTQ969P6 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TOP1MTQ969P6 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TOP1MTQ969P6 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TOP1MTQ969P6 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TOP1MTQ969P6 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TOP1MTQ969P6 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TOP1MTQ969P6 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TOP1MTQ969P6 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TOP1MTQ969P6 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TOP1MTQ969P6 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TOP1MTQ969P6 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TOP1MTQ969P6 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TOP1MTQ969P6 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TOP1MTQ969P6 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TOP1MTQ969P6 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TOP1MTQ969P6 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TOP1MTQ969P6 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TOP1MTQ969P6 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TOP1MTQ969P6 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TOP1MTQ969P6 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
TOP1MTQ969P6 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TOP1MTQ969P6 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TOP1MTQ969P6 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
TOP1MTQ969P6 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TOP1MTQ969P6 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TOP1MTQ969P6 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TOP1MTQ969P6 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TOP1MTQ969P6 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TOP1MTQ969P6 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TOP1MTQ969P6 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TOP1MTQ969P6 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TOP1MTQ969P6 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TOP1MTQ969P6 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TOP1MTQ969P6 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TOP1MTQ969P6 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TOP1MTQ969P6 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TOP1MTQ969P6 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TOP1MTQ969P6 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TOP1MTQ969P6 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
TOP1MTQ969P6 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TOP1MTQ969P6 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TOP1MTQ969P6 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TOP1MTQ969P6 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TOP1MTQ969P6 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TOP1MTQ969P6 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TOP1MTQ969P6 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TOP1MTQ969P6 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TOP1MTQ969P6 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TOP1MTQ969P6 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TOP1MTQ969P6 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TOP1MTQ969P6 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TOP1MTQ969P6 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TOP1MTQ969P6 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TOP1MTQ969P6 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
TOP1MTQ969P6 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TOP1MTQ969P6 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TOP1MTQ969P6 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TOP1MTQ969P6 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TOP1MTQ969P6 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TOP1MTQ969P6 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TOP1MTQ969P6 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TOP1MTQ969P6 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TOP1MTQ969P6 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TOP1MTQ969P6 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TOP1MTQ969P6 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TOP1MTQ969P6 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TOP1MTQ969P6 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TOP1MTQ969P6 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
TOP1MTQ969P6 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TOP1MTQ969P6 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TOP1MTQ969P6 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TOP1MTQ969P6 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TOP1MTQ969P6 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
TOP1MTQ969P6 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TOP1MTQ969P6 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TOP1MTQ969P6 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
TOP1MTQ969P6 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TOP1MTQ969P6 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TOP1MTQ969P6 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TOP1MTQ969P6 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TOP1MTQ969P6 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TOP1MTQ969P6 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TOP1MTQ969P6 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TOP1MTQ969P6 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
TOP1MTQ969P6 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TOP1MTQ969P6 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TOP1MTQ969P6 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TOP1MTQ969P6 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TOP1MTQ969P6 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TOP1MTQ969P6 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms