Protein–RNA interactions for Protein: Q93084

ATP2A3, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2A3Q93084 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP2A3Q93084 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP2A3Q93084 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP2A3Q93084 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP2A3Q93084 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP2A3Q93084 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP2A3Q93084 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP2A3Q93084 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP2A3Q93084 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP2A3Q93084 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP2A3Q93084 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP2A3Q93084 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP2A3Q93084 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP2A3Q93084 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP2A3Q93084 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP2A3Q93084 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP2A3Q93084 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP2A3Q93084 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP2A3Q93084 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP2A3Q93084 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP2A3Q93084 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP2A3Q93084 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP2A3Q93084 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP2A3Q93084 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP2A3Q93084 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP2A3Q93084 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP2A3Q93084 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP2A3Q93084 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP2A3Q93084 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP2A3Q93084 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP2A3Q93084 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP2A3Q93084 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP2A3Q93084 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP2A3Q93084 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP2A3Q93084 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP2A3Q93084 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP2A3Q93084 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP2A3Q93084 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP2A3Q93084 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP2A3Q93084 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATP2A3Q93084 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATP2A3Q93084 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATP2A3Q93084 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATP2A3Q93084 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATP2A3Q93084 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATP2A3Q93084 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATP2A3Q93084 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
ATP2A3Q93084 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATP2A3Q93084 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23■■□□□ 1.27
ATP2A3Q93084 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATP2A3Q93084 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ATP2A3Q93084 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATP2A3Q93084 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATP2A3Q93084 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ATP2A3Q93084 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP2A3Q93084 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP2A3Q93084 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP2A3Q93084 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP2A3Q93084 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP2A3Q93084 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP2A3Q93084 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP2A3Q93084 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP2A3Q93084 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP2A3Q93084 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP2A3Q93084 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP2A3Q93084 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP2A3Q93084 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP2A3Q93084 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP2A3Q93084 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP2A3Q93084 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP2A3Q93084 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP2A3Q93084 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP2A3Q93084 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP2A3Q93084 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP2A3Q93084 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP2A3Q93084 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP2A3Q93084 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP2A3Q93084 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP2A3Q93084 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP2A3Q93084 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP2A3Q93084 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP2A3Q93084 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP2A3Q93084 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP2A3Q93084 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP2A3Q93084 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP2A3Q93084 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP2A3Q93084 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP2A3Q93084 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP2A3Q93084 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP2A3Q93084 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP2A3Q93084 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP2A3Q93084 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP2A3Q93084 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP2A3Q93084 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP2A3Q93084 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP2A3Q93084 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP2A3Q93084 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP2A3Q93084 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP2A3Q93084 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP2A3Q93084 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms