Protein–RNA interactions for Protein: Q93009

USP7, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 7, humanhuman

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Length 1,102 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP7Q93009 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP7Q93009 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP7Q93009 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP7Q93009 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP7Q93009 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP7Q93009 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP7Q93009 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
USP7Q93009 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP7Q93009 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP7Q93009 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP7Q93009 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP7Q93009 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP7Q93009 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP7Q93009 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP7Q93009 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP7Q93009 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
USP7Q93009 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
USP7Q93009 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
USP7Q93009 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
USP7Q93009 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
USP7Q93009 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
USP7Q93009 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
USP7Q93009 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
USP7Q93009 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
USP7Q93009 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
USP7Q93009 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
USP7Q93009 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
USP7Q93009 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
USP7Q93009 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
USP7Q93009 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
USP7Q93009 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
USP7Q93009 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP7Q93009 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP7Q93009 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP7Q93009 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP7Q93009 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP7Q93009 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP7Q93009 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP7Q93009 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
USP7Q93009 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP7Q93009 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP7Q93009 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP7Q93009 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
USP7Q93009 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP7Q93009 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP7Q93009 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP7Q93009 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP7Q93009 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP7Q93009 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP7Q93009 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP7Q93009 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP7Q93009 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP7Q93009 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP7Q93009 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP7Q93009 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP7Q93009 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP7Q93009 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
USP7Q93009 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
USP7Q93009 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP7Q93009 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP7Q93009 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP7Q93009 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP7Q93009 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP7Q93009 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP7Q93009 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP7Q93009 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP7Q93009 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP7Q93009 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP7Q93009 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP7Q93009 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP7Q93009 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP7Q93009 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP7Q93009 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP7Q93009 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP7Q93009 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP7Q93009 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP7Q93009 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP7Q93009 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP7Q93009 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
USP7Q93009 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP7Q93009 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP7Q93009 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP7Q93009 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP7Q93009 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
USP7Q93009 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
USP7Q93009 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP7Q93009 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP7Q93009 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP7Q93009 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP7Q93009 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP7Q93009 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP7Q93009 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP7Q93009 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP7Q93009 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP7Q93009 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP7Q93009 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP7Q93009 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP7Q93009 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP7Q93009 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP7Q93009 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
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