Protein–RNA interactions for Protein: Q92466

DDB2, DNA damage-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB2Q92466 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
DDB2Q92466 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DDB2Q92466 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DDB2Q92466 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DDB2Q92466 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DDB2Q92466 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DDB2Q92466 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
DDB2Q92466 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DDB2Q92466 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DDB2Q92466 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DDB2Q92466 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DDB2Q92466 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DDB2Q92466 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DDB2Q92466 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DDB2Q92466 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DDB2Q92466 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DDB2Q92466 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
DDB2Q92466 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DDB2Q92466 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DDB2Q92466 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DDB2Q92466 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DDB2Q92466 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DDB2Q92466 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DDB2Q92466 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DDB2Q92466 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DDB2Q92466 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DDB2Q92466 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DDB2Q92466 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DDB2Q92466 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
DDB2Q92466 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DDB2Q92466 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DDB2Q92466 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DDB2Q92466 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DDB2Q92466 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DDB2Q92466 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DDB2Q92466 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DDB2Q92466 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DDB2Q92466 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DDB2Q92466 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DDB2Q92466 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DDB2Q92466 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DDB2Q92466 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DDB2Q92466 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DDB2Q92466 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DDB2Q92466 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DDB2Q92466 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DDB2Q92466 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DDB2Q92466 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
DDB2Q92466 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
DDB2Q92466 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
DDB2Q92466 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
DDB2Q92466 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DDB2Q92466 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DDB2Q92466 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DDB2Q92466 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DDB2Q92466 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DDB2Q92466 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DDB2Q92466 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
DDB2Q92466 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
DDB2Q92466 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
DDB2Q92466 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
DDB2Q92466 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
DDB2Q92466 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DDB2Q92466 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DDB2Q92466 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DDB2Q92466 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DDB2Q92466 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DDB2Q92466 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DDB2Q92466 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DDB2Q92466 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DDB2Q92466 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DDB2Q92466 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DDB2Q92466 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
DDB2Q92466 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DDB2Q92466 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DDB2Q92466 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DDB2Q92466 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DDB2Q92466 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DDB2Q92466 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DDB2Q92466 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DDB2Q92466 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DDB2Q92466 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DDB2Q92466 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DDB2Q92466 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DDB2Q92466 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
DDB2Q92466 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DDB2Q92466 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DDB2Q92466 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DDB2Q92466 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DDB2Q92466 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DDB2Q92466 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DDB2Q92466 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DDB2Q92466 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DDB2Q92466 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DDB2Q92466 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DDB2Q92466 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DDB2Q92466 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DDB2Q92466 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DDB2Q92466 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DDB2Q92466 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms