Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW27

APOBEC4, Putative C->U-editing enzyme APOBEC-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC4Q8WW27 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
APOBEC4Q8WW27 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
APOBEC4Q8WW27 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
APOBEC4Q8WW27 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
APOBEC4Q8WW27 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
APOBEC4Q8WW27 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
APOBEC4Q8WW27 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
APOBEC4Q8WW27 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
APOBEC4Q8WW27 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
APOBEC4Q8WW27 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
APOBEC4Q8WW27 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
APOBEC4Q8WW27 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
APOBEC4Q8WW27 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
APOBEC4Q8WW27 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
APOBEC4Q8WW27 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
APOBEC4Q8WW27 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
APOBEC4Q8WW27 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
APOBEC4Q8WW27 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
APOBEC4Q8WW27 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC20.99■□□□□ 0.95
APOBEC4Q8WW27 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
APOBEC4Q8WW27 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
APOBEC4Q8WW27 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
APOBEC4Q8WW27 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
APOBEC4Q8WW27 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
APOBEC4Q8WW27 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
APOBEC4Q8WW27 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
APOBEC4Q8WW27 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
APOBEC4Q8WW27 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
APOBEC4Q8WW27 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
APOBEC4Q8WW27 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
APOBEC4Q8WW27 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
APOBEC4Q8WW27 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
APOBEC4Q8WW27 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
APOBEC4Q8WW27 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
APOBEC4Q8WW27 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
APOBEC4Q8WW27 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
APOBEC4Q8WW27 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
APOBEC4Q8WW27 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
APOBEC4Q8WW27 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
APOBEC4Q8WW27 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
APOBEC4Q8WW27 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
APOBEC4Q8WW27 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
APOBEC4Q8WW27 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
APOBEC4Q8WW27 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
APOBEC4Q8WW27 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
APOBEC4Q8WW27 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC20.97■□□□□ 0.95
APOBEC4Q8WW27 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
APOBEC4Q8WW27 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
APOBEC4Q8WW27 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
APOBEC4Q8WW27 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
APOBEC4Q8WW27 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
APOBEC4Q8WW27 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
APOBEC4Q8WW27 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
APOBEC4Q8WW27 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
APOBEC4Q8WW27 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
APOBEC4Q8WW27 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
APOBEC4Q8WW27 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
APOBEC4Q8WW27 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
APOBEC4Q8WW27 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
APOBEC4Q8WW27 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
APOBEC4Q8WW27 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
APOBEC4Q8WW27 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
APOBEC4Q8WW27 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
APOBEC4Q8WW27 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
APOBEC4Q8WW27 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
APOBEC4Q8WW27 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
APOBEC4Q8WW27 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
APOBEC4Q8WW27 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
APOBEC4Q8WW27 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
APOBEC4Q8WW27 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
APOBEC4Q8WW27 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
APOBEC4Q8WW27 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
APOBEC4Q8WW27 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
APOBEC4Q8WW27 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
APOBEC4Q8WW27 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
APOBEC4Q8WW27 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
APOBEC4Q8WW27 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
APOBEC4Q8WW27 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
APOBEC4Q8WW27 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
APOBEC4Q8WW27 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
APOBEC4Q8WW27 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
APOBEC4Q8WW27 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
APOBEC4Q8WW27 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
APOBEC4Q8WW27 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
APOBEC4Q8WW27 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
APOBEC4Q8WW27 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
APOBEC4Q8WW27 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
APOBEC4Q8WW27 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
APOBEC4Q8WW27 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
APOBEC4Q8WW27 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
APOBEC4Q8WW27 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
APOBEC4Q8WW27 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
APOBEC4Q8WW27 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
APOBEC4Q8WW27 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
APOBEC4Q8WW27 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
APOBEC4Q8WW27 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
APOBEC4Q8WW27 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
APOBEC4Q8WW27 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
APOBEC4Q8WW27 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
APOBEC4Q8WW27 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms