Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUA8

TSKU, Tsukushin, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSKUQ8WUA8 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TSKUQ8WUA8 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TSKUQ8WUA8 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TSKUQ8WUA8 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TSKUQ8WUA8 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TSKUQ8WUA8 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TSKUQ8WUA8 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TSKUQ8WUA8 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TSKUQ8WUA8 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TSKUQ8WUA8 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TSKUQ8WUA8 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TSKUQ8WUA8 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TSKUQ8WUA8 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TSKUQ8WUA8 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TSKUQ8WUA8 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TSKUQ8WUA8 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TSKUQ8WUA8 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TSKUQ8WUA8 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TSKUQ8WUA8 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TSKUQ8WUA8 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TSKUQ8WUA8 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TSKUQ8WUA8 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TSKUQ8WUA8 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TSKUQ8WUA8 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TSKUQ8WUA8 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TSKUQ8WUA8 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TSKUQ8WUA8 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TSKUQ8WUA8 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TSKUQ8WUA8 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TSKUQ8WUA8 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TSKUQ8WUA8 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TSKUQ8WUA8 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TSKUQ8WUA8 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TSKUQ8WUA8 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TSKUQ8WUA8 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TSKUQ8WUA8 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TSKUQ8WUA8 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TSKUQ8WUA8 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TSKUQ8WUA8 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TSKUQ8WUA8 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TSKUQ8WUA8 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TSKUQ8WUA8 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TSKUQ8WUA8 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TSKUQ8WUA8 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TSKUQ8WUA8 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TSKUQ8WUA8 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TSKUQ8WUA8 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TSKUQ8WUA8 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TSKUQ8WUA8 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TSKUQ8WUA8 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TSKUQ8WUA8 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TSKUQ8WUA8 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TSKUQ8WUA8 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TSKUQ8WUA8 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TSKUQ8WUA8 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TSKUQ8WUA8 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TSKUQ8WUA8 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TSKUQ8WUA8 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TSKUQ8WUA8 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TSKUQ8WUA8 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TSKUQ8WUA8 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TSKUQ8WUA8 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TSKUQ8WUA8 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TSKUQ8WUA8 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TSKUQ8WUA8 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TSKUQ8WUA8 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TSKUQ8WUA8 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TSKUQ8WUA8 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TSKUQ8WUA8 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TSKUQ8WUA8 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TSKUQ8WUA8 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TSKUQ8WUA8 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TSKUQ8WUA8 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TSKUQ8WUA8 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TSKUQ8WUA8 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TSKUQ8WUA8 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TSKUQ8WUA8 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TSKUQ8WUA8 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TSKUQ8WUA8 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TSKUQ8WUA8 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TSKUQ8WUA8 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TSKUQ8WUA8 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TSKUQ8WUA8 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TSKUQ8WUA8 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TSKUQ8WUA8 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TSKUQ8WUA8 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TSKUQ8WUA8 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TSKUQ8WUA8 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TSKUQ8WUA8 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TSKUQ8WUA8 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TSKUQ8WUA8 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TSKUQ8WUA8 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TSKUQ8WUA8 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TSKUQ8WUA8 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TSKUQ8WUA8 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
TSKUQ8WUA8 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
TSKUQ8WUA8 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TSKUQ8WUA8 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TSKUQ8WUA8 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TSKUQ8WUA8 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms