Protein–RNA interactions for Protein: Q8TF64

GIPC3, PDZ domain-containing protein GIPC3, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC3Q8TF64 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GIPC3Q8TF64 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GIPC3Q8TF64 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GIPC3Q8TF64 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
GIPC3Q8TF64 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GIPC3Q8TF64 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GIPC3Q8TF64 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GIPC3Q8TF64 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GIPC3Q8TF64 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GIPC3Q8TF64 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GIPC3Q8TF64 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GIPC3Q8TF64 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GIPC3Q8TF64 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GIPC3Q8TF64 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
GIPC3Q8TF64 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GIPC3Q8TF64 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GIPC3Q8TF64 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GIPC3Q8TF64 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GIPC3Q8TF64 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GIPC3Q8TF64 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GIPC3Q8TF64 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GIPC3Q8TF64 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GIPC3Q8TF64 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GIPC3Q8TF64 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GIPC3Q8TF64 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GIPC3Q8TF64 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GIPC3Q8TF64 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GIPC3Q8TF64 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GIPC3Q8TF64 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GIPC3Q8TF64 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GIPC3Q8TF64 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GIPC3Q8TF64 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GIPC3Q8TF64 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GIPC3Q8TF64 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GIPC3Q8TF64 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GIPC3Q8TF64 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GIPC3Q8TF64 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GIPC3Q8TF64 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GIPC3Q8TF64 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GIPC3Q8TF64 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GIPC3Q8TF64 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GIPC3Q8TF64 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GIPC3Q8TF64 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GIPC3Q8TF64 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GIPC3Q8TF64 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GIPC3Q8TF64 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GIPC3Q8TF64 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GIPC3Q8TF64 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GIPC3Q8TF64 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GIPC3Q8TF64 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GIPC3Q8TF64 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GIPC3Q8TF64 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GIPC3Q8TF64 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GIPC3Q8TF64 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GIPC3Q8TF64 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GIPC3Q8TF64 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GIPC3Q8TF64 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GIPC3Q8TF64 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GIPC3Q8TF64 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GIPC3Q8TF64 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GIPC3Q8TF64 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GIPC3Q8TF64 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GIPC3Q8TF64 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GIPC3Q8TF64 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GIPC3Q8TF64 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GIPC3Q8TF64 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GIPC3Q8TF64 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GIPC3Q8TF64 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GIPC3Q8TF64 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GIPC3Q8TF64 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GIPC3Q8TF64 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GIPC3Q8TF64 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
GIPC3Q8TF64 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
GIPC3Q8TF64 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GIPC3Q8TF64 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GIPC3Q8TF64 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GIPC3Q8TF64 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GIPC3Q8TF64 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GIPC3Q8TF64 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
GIPC3Q8TF64 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GIPC3Q8TF64 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GIPC3Q8TF64 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
GIPC3Q8TF64 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GIPC3Q8TF64 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GIPC3Q8TF64 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GIPC3Q8TF64 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
GIPC3Q8TF64 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GIPC3Q8TF64 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GIPC3Q8TF64 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GIPC3Q8TF64 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
GIPC3Q8TF64 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GIPC3Q8TF64 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GIPC3Q8TF64 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GIPC3Q8TF64 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GIPC3Q8TF64 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GIPC3Q8TF64 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GIPC3Q8TF64 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GIPC3Q8TF64 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GIPC3Q8TF64 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GIPC3Q8TF64 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms