Protein–RNA interactions for Protein: Q8TB72

PUM2, Pumilio homolog 2, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM2Q8TB72 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.863e-8■■■■■ 42.4
PUM2Q8TB72 TOLLIP-204ENST00000527085 595 ntTSL 520.43■□□□□ 0.863e-8■■■■■ 42.4
PUM2Q8TB72 MAP2K4-213ENST00000602537 948 ntTSL 520.19■□□□□ 0.823e-8■■■■■ 42.4
PUM2Q8TB72 MAP2K4-212ENST00000602375 1064 ntTSL 520■□□□□ 0.793e-8■■■■■ 42.4
PUM2Q8TB72 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.713e-8■■■■■ 42.4
PUM2Q8TB72 TOLLIP-206ENST00000527746 590 ntTSL 219.18■□□□□ 0.663e-8■■■■■ 42.4
PUM2Q8TB72 LIN9-202ENST00000359525 686 ntTSL 318.97■□□□□ 0.633e-8■■■■■ 42.4
PUM2Q8TB72 NR2C2-204ENST00000413118 564 ntTSL 418.88■□□□□ 0.612e-6■■■■■ 42.4
PUM2Q8TB72 MAP2K4-214ENST00000602686 977 ntTSL 518.85■□□□□ 0.613e-8■■■■■ 42.4
PUM2Q8TB72 TOLLIP-210ENST00000530506 1297 ntTSL 518.58■□□□□ 0.563e-8■■■■■ 42.4
PUM2Q8TB72 TOLLIP-205ENST00000527638 561 ntTSL 418.58■□□□□ 0.563e-8■■■■■ 42.4
PUM2Q8TB72 MTMR1-210ENST00000488357 1967 ntTSL 218.27■□□□□ 0.523e-8■■■■■ 42.4
PUM2Q8TB72 ERCC1-207ENST00000588738 586 ntTSL 217.43■□□□□ 0.383e-8■■■■■ 42.4
PUM2Q8TB72 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.343e-8■■■■■ 42.4
PUM2Q8TB72 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.13e-8■■■■■ 42.4
PUM2Q8TB72 ATL2-211ENST00000456736 578 ntTSL 315.41■□□□□ 0.063e-8■■■■■ 42.4
PUM2Q8TB72 TOLLIP-211ENST00000530541 684 ntTSL 215.06■□□□□ 03e-8■■■■■ 42.4
PUM2Q8TB72 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.113e-8■■■■■ 42.4
PUM2Q8TB72 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.183e-8■■■■■ 42.4
PUM2Q8TB72 ATL2-208ENST00000449130 526 ntTSL 313.76□□□□□ -0.213e-8■■■■■ 42.4
PUM2Q8TB72 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.263e-8■■■■■ 42.4
PUM2Q8TB72 TOLLIP-202ENST00000317204 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.273e-8■■■■■ 42.4
PUM2Q8TB72 YIPF1-201ENST00000072644 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.33e-8■■■■■ 42.4
PUM2Q8TB72 TOLLIP-212ENST00000530821 428 ntTSL 313.14□□□□□ -0.313e-8■■■■■ 42.4
PUM2Q8TB72 TOLLIP-203ENST00000525159 3429 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.353e-8■■■■■ 42.4
PUM2Q8TB72 ERCC1-211ENST00000590701 345 ntTSL 312.85□□□□□ -0.353e-8■■■■■ 42.4
PUM2Q8TB72 ERCC1-208ENST00000589165 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.363e-8■■■■■ 42.4
PUM2Q8TB72 ATG10-201ENST00000282185 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.463e-8■■■■■ 42.4
PUM2Q8TB72 TOLLIP-213ENST00000532551 576 ntTSL 212.07□□□□□ -0.483e-8■■■■■ 42.4
PUM2Q8TB72 ERCC1-202ENST00000300853 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.593e-8■■■■■ 42.4
PUM2Q8TB72 YIPF1-202ENST00000371399 1503 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.633e-8■■■■■ 42.4
PUM2Q8TB72 CUL5-201ENST00000393094 6351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.673e-8■■■■■ 42.4
PUM2Q8TB72 MAP2K4-202ENST00000415385 3856 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.743e-8■■■■■ 42.4
PUM2Q8TB72 ATL2-207ENST00000443098 775 ntTSL 510.07□□□□□ -0.83e-8■■■■■ 42.4
PUM2Q8TB72 PPWD1-207ENST00000510930 2019 ntTSL 210.04□□□□□ -0.83e-8■■■■■ 42.4
PUM2Q8TB72 PPWD1-210ENST00000513773 955 ntTSL 29.94□□□□□ -0.823e-8■■■■■ 42.4
PUM2Q8TB72 PPWD1-209ENST00000511908 1981 ntTSL 28.29□□□□□ -1.083e-8■■■■■ 42.4
PUM2Q8TB72 PPWD1-215ENST00000538977 2055 ntTSL 2 BASIC8.25□□□□□ -1.093e-8■■■■■ 42.4
PUM2Q8TB72 MAP2K4-204ENST00000538465 925 ntTSL 57.68□□□□□ -1.183e-8■■■■■ 42.4
PUM2Q8TB72 SMIM13-201ENST00000376935 1251 ntTSL 57.43□□□□□ -1.223e-8■■■■■ 42.4
PUM2Q8TB72 PPWD1-201ENST00000261308 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.273e-8■■■■■ 42.4
PUM2Q8TB72 PPWD1-214ENST00000535264 2195 ntTSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.273e-8■■■■■ 42.4
PUM2Q8TB72 MAP2K4-205ENST00000579089 571 ntTSL 47.07□□□□□ -1.283e-8■■■■■ 42.4
PUM2Q8TB72 MAP2K4-206ENST00000581941 813 ntTSL 37.03□□□□□ -1.283e-8■■■■■ 42.4
PUM2Q8TB72 ATG10-209ENST00000514253 904 ntTSL 36.57□□□□□ -1.363e-8■■■■■ 42.4
PUM2Q8TB72 CUL5-203ENST00000531427 3596 ntTSL 1 (best)6.52□□□□□ -1.373e-8■■■■■ 42.4
PUM2Q8TB72 MAP2K4-208ENST00000582377 648 ntTSL 36.46□□□□□ -1.383e-8■■■■■ 42.4
PUM2Q8TB72 YIPF1-203ENST00000464950 1602 ntTSL 1 (best)4.87□□□□□ -1.633e-8■■■■■ 42.4
PUM2Q8TB72 KIF15-203ENST00000425755 3460 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.663e-8■■■■■ 42.4
PUM2Q8TB72 ATG10-205ENST00000508814 413 ntTSL 34.31□□□□□ -1.723e-8■■■■■ 42.4
PUM2Q8TB72 ZNF204P-201ENST00000416749 2397 ntBASIC3.46□□□□□ -1.863e-8■■■■■ 42.4
PUM2Q8TB72 PIK3CA-201ENST00000263967 9093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.67□□□□□ -1.984e-10■■■■■ 42.4
PUM2Q8TB72 LINC00854-214ENST00000615433 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 58.14□□□□□ -1.116e-16■■■■■ 42.3
PUM2Q8TB72 LINC00854-204ENST00000594691 649 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.216e-16■■■■■ 42.3
PUM2Q8TB72 U2.6-201ENST00000619225 191 ntBASIC2.89□□□□□ -1.956e-16■■■■■ 42.3
PUM2Q8TB72 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.186e-8■■■■■ 42.2
PUM2Q8TB72 KIF18B-202ENST00000587309 4217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.851e-15■■■■■ 42.1
PUM2Q8TB72 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.452e-17■■■■■ 42.1
PUM2Q8TB72 AK3-204ENST00000611749 4029 ntTSL 4 BASIC9.27□□□□□ -0.932e-17■■■■■ 42.1
PUM2Q8TB72 AK3-201ENST00000359883 1536 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.972e-17■■■■■ 42.1
PUM2Q8TB72 CNOT8-217ENST00000521450 1158 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.494e-10■■■■■ 42.1
PUM2Q8TB72 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.043e-8■■■■■ 42.1
PUM2Q8TB72 FRYL-202ENST00000358350 11706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.384e-7■■■■■ 42.1
PUM2Q8TB72 FRYL-211ENST00000507873 7031 ntTSL 1 (best)4.91□□□□□ -1.624e-7■■■■■ 42.1
PUM2Q8TB72 FRYL-205ENST00000503238 11103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.84e-7■■■■■ 42.1
PUM2Q8TB72 PRPS2-202ENST00000380668 2511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.476e-7■■■■■ 42
PUM2Q8TB72 ARID2-201ENST00000334344 8642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -12e-7■■■■■ 42
PUM2Q8TB72 ARID2-205ENST00000444670 7316 ntTSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.72e-7■■■■■ 42
PUM2Q8TB72 ARID2-206ENST00000457135 4356 ntTSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.792e-7■■■■■ 42
PUM2Q8TB72 ARID2-208ENST00000479608 7761 ntTSL 1 (best)3.79□□□□□ -1.82e-7■■■■■ 42
PUM2Q8TB72 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.223e-13■■■■■ 42
PUM2Q8TB72 BLM-210ENST00000560821 1024 ntTSL 211.22□□□□□ -0.612e-6■■■■■ 42
PUM2Q8TB72 BLM-203ENST00000558825 1683 ntTSL 59.27□□□□□ -0.932e-6■■■■■ 42
PUM2Q8TB72 BLM-201ENST00000355112 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.352e-6■■■■■ 42
PUM2Q8TB72 BLM-206ENST00000559724 4510 ntTSL 1 (best)5.17□□□□□ -1.582e-6■■■■■ 42
PUM2Q8TB72 BLM-208ENST00000560509 3966 ntTSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.822e-6■■■■■ 42
PUM2Q8TB72 TWSG1-201ENST00000262120 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.367e-7■■■■■ 41.9
PUM2Q8TB72 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.036e-9■■■■■ 41.9
PUM2Q8TB72 GOLGA5-202ENST00000554700 759 ntTSL 1 (best)4.69□□□□□ -1.666e-9■■■■■ 41.9
PUM2Q8TB72 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.342e-10■■■■■ 41.9
PUM2Q8TB72 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.032e-10■■■■■ 41.9
PUM2Q8TB72 CLSTN1-205ENST00000477264 2169 ntTSL 214.5□□□□□ -0.092e-10■■■■■ 41.9
PUM2Q8TB72 CLSTN1-203ENST00000435891 3829 ntTSL 29.98□□□□□ -0.812e-10■■■■■ 41.9
PUM2Q8TB72 BRCA1-201ENST00000352993 3668 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.248e-23■■■■■ 41.9
PUM2Q8TB72 BRCA1-203ENST00000357654 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.58e-23■■■■■ 41.9
PUM2Q8TB72 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.338e-14■■■■■ 41.9
PUM2Q8TB72 EIF2AK3-203ENST00000419748 4222 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.658e-14■■■■■ 41.9
PUM2Q8TB72 CCNE2-205ENST00000520509 3330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.37e-7■■■■■ 41.8
PUM2Q8TB72 CCNE2-201ENST00000308108 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.37e-7■■■■■ 41.8
PUM2Q8TB72 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.981e-8■■■■■ 41.8
PUM2Q8TB72 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.371e-8■■■■■ 41.8
PUM2Q8TB72 AEBP2-202ENST00000360995 2533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.93□□□□□ -0.981e-8■■■■■ 41.8
PUM2Q8TB72 AEBP2-203ENST00000398731 722 ntTSL 38.16□□□□□ -1.11e-8■■■■■ 41.8
PUM2Q8TB72 AEBP2-205ENST00000512223 507 ntTSL 34.89□□□□□ -1.631e-8■■■■■ 41.8
PUM2Q8TB72 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.019e-10■■■■■ 41.8
PUM2Q8TB72 IGF2R-203ENST00000475584 597 ntTSL 314.04□□□□□ -0.163e-55■■■■■ 41.8
PUM2Q8TB72 IGF2R-201ENST00000356956 14044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.353e-55■■■■■ 41.8
PUM2Q8TB72 GALNT7-201ENST00000265000 4307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.348e-7■■■■■ 41.8
PUM2Q8TB72 GALNT7-207ENST00000515862 3569 ntTSL 24.4□□□□□ -1.78e-7■■■■■ 41.8
PUM2Q8TB72 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.162e-10■■■■■ 41.8
Retrieved 100 of 17,637 protein–RNA pairs in 241.7 ms