Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEB9

PIK3C3, Phosphatidylinositol 3-kinase catalytic subunit type 3, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C3Q8NEB9 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PIK3C3Q8NEB9 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PIK3C3Q8NEB9 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PIK3C3Q8NEB9 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PIK3C3Q8NEB9 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PIK3C3Q8NEB9 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PIK3C3Q8NEB9 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
PIK3C3Q8NEB9 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PIK3C3Q8NEB9 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PIK3C3Q8NEB9 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PIK3C3Q8NEB9 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PIK3C3Q8NEB9 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PIK3C3Q8NEB9 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PIK3C3Q8NEB9 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PIK3C3Q8NEB9 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PIK3C3Q8NEB9 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PIK3C3Q8NEB9 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PIK3C3Q8NEB9 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PIK3C3Q8NEB9 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PIK3C3Q8NEB9 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PIK3C3Q8NEB9 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PIK3C3Q8NEB9 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PIK3C3Q8NEB9 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PIK3C3Q8NEB9 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PIK3C3Q8NEB9 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PIK3C3Q8NEB9 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PIK3C3Q8NEB9 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PIK3C3Q8NEB9 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PIK3C3Q8NEB9 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PIK3C3Q8NEB9 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PIK3C3Q8NEB9 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PIK3C3Q8NEB9 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PIK3C3Q8NEB9 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PIK3C3Q8NEB9 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PIK3C3Q8NEB9 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PIK3C3Q8NEB9 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PIK3C3Q8NEB9 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PIK3C3Q8NEB9 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PIK3C3Q8NEB9 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PIK3C3Q8NEB9 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PIK3C3Q8NEB9 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PIK3C3Q8NEB9 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PIK3C3Q8NEB9 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PIK3C3Q8NEB9 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PIK3C3Q8NEB9 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PIK3C3Q8NEB9 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PIK3C3Q8NEB9 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PIK3C3Q8NEB9 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PIK3C3Q8NEB9 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PIK3C3Q8NEB9 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PIK3C3Q8NEB9 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PIK3C3Q8NEB9 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PIK3C3Q8NEB9 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PIK3C3Q8NEB9 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PIK3C3Q8NEB9 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PIK3C3Q8NEB9 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PIK3C3Q8NEB9 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PIK3C3Q8NEB9 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PIK3C3Q8NEB9 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PIK3C3Q8NEB9 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PIK3C3Q8NEB9 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PIK3C3Q8NEB9 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PIK3C3Q8NEB9 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PIK3C3Q8NEB9 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PIK3C3Q8NEB9 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PIK3C3Q8NEB9 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PIK3C3Q8NEB9 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PIK3C3Q8NEB9 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PIK3C3Q8NEB9 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PIK3C3Q8NEB9 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PIK3C3Q8NEB9 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PIK3C3Q8NEB9 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PIK3C3Q8NEB9 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PIK3C3Q8NEB9 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PIK3C3Q8NEB9 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PIK3C3Q8NEB9 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PIK3C3Q8NEB9 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PIK3C3Q8NEB9 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PIK3C3Q8NEB9 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PIK3C3Q8NEB9 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PIK3C3Q8NEB9 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PIK3C3Q8NEB9 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PIK3C3Q8NEB9 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PIK3C3Q8NEB9 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PIK3C3Q8NEB9 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PIK3C3Q8NEB9 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PIK3C3Q8NEB9 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PIK3C3Q8NEB9 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PIK3C3Q8NEB9 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PIK3C3Q8NEB9 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PIK3C3Q8NEB9 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PIK3C3Q8NEB9 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PIK3C3Q8NEB9 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PIK3C3Q8NEB9 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PIK3C3Q8NEB9 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PIK3C3Q8NEB9 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PIK3C3Q8NEB9 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PIK3C3Q8NEB9 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.87
PIK3C3Q8NEB9 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PIK3C3Q8NEB9 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms