Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCJ5

SPRYD3, SPRY domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRYD3Q8NCJ5 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SPRYD3Q8NCJ5 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SPRYD3Q8NCJ5 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SPRYD3Q8NCJ5 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SPRYD3Q8NCJ5 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SPRYD3Q8NCJ5 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SPRYD3Q8NCJ5 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
SPRYD3Q8NCJ5 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SPRYD3Q8NCJ5 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SPRYD3Q8NCJ5 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SPRYD3Q8NCJ5 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SPRYD3Q8NCJ5 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SPRYD3Q8NCJ5 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SPRYD3Q8NCJ5 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SPRYD3Q8NCJ5 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SPRYD3Q8NCJ5 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SPRYD3Q8NCJ5 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SPRYD3Q8NCJ5 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SPRYD3Q8NCJ5 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SPRYD3Q8NCJ5 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SPRYD3Q8NCJ5 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SPRYD3Q8NCJ5 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SPRYD3Q8NCJ5 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
SPRYD3Q8NCJ5 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SPRYD3Q8NCJ5 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SPRYD3Q8NCJ5 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SPRYD3Q8NCJ5 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SPRYD3Q8NCJ5 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SPRYD3Q8NCJ5 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SPRYD3Q8NCJ5 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SPRYD3Q8NCJ5 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SPRYD3Q8NCJ5 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SPRYD3Q8NCJ5 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SPRYD3Q8NCJ5 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SPRYD3Q8NCJ5 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SPRYD3Q8NCJ5 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SPRYD3Q8NCJ5 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
SPRYD3Q8NCJ5 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SPRYD3Q8NCJ5 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SPRYD3Q8NCJ5 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SPRYD3Q8NCJ5 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SPRYD3Q8NCJ5 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
SPRYD3Q8NCJ5 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SPRYD3Q8NCJ5 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SPRYD3Q8NCJ5 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SPRYD3Q8NCJ5 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SPRYD3Q8NCJ5 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SPRYD3Q8NCJ5 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SPRYD3Q8NCJ5 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SPRYD3Q8NCJ5 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SPRYD3Q8NCJ5 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SPRYD3Q8NCJ5 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SPRYD3Q8NCJ5 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SPRYD3Q8NCJ5 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SPRYD3Q8NCJ5 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SPRYD3Q8NCJ5 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SPRYD3Q8NCJ5 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SPRYD3Q8NCJ5 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SPRYD3Q8NCJ5 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SPRYD3Q8NCJ5 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SPRYD3Q8NCJ5 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SPRYD3Q8NCJ5 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SPRYD3Q8NCJ5 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SPRYD3Q8NCJ5 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SPRYD3Q8NCJ5 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SPRYD3Q8NCJ5 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SPRYD3Q8NCJ5 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SPRYD3Q8NCJ5 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SPRYD3Q8NCJ5 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
SPRYD3Q8NCJ5 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SPRYD3Q8NCJ5 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SPRYD3Q8NCJ5 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SPRYD3Q8NCJ5 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SPRYD3Q8NCJ5 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SPRYD3Q8NCJ5 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SPRYD3Q8NCJ5 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SPRYD3Q8NCJ5 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SPRYD3Q8NCJ5 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SPRYD3Q8NCJ5 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SPRYD3Q8NCJ5 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SPRYD3Q8NCJ5 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SPRYD3Q8NCJ5 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
SPRYD3Q8NCJ5 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SPRYD3Q8NCJ5 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SPRYD3Q8NCJ5 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
SPRYD3Q8NCJ5 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SPRYD3Q8NCJ5 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SPRYD3Q8NCJ5 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SPRYD3Q8NCJ5 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
SPRYD3Q8NCJ5 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SPRYD3Q8NCJ5 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SPRYD3Q8NCJ5 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SPRYD3Q8NCJ5 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SPRYD3Q8NCJ5 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SPRYD3Q8NCJ5 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SPRYD3Q8NCJ5 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SPRYD3Q8NCJ5 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SPRYD3Q8NCJ5 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SPRYD3Q8NCJ5 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SPRYD3Q8NCJ5 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms