Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBT2

SPC24, Kinetochore protein Spc24, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPC24Q8NBT2 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SPC24Q8NBT2 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SPC24Q8NBT2 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SPC24Q8NBT2 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SPC24Q8NBT2 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SPC24Q8NBT2 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SPC24Q8NBT2 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPC24Q8NBT2 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPC24Q8NBT2 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPC24Q8NBT2 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPC24Q8NBT2 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPC24Q8NBT2 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPC24Q8NBT2 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPC24Q8NBT2 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SPC24Q8NBT2 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SPC24Q8NBT2 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SPC24Q8NBT2 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
SPC24Q8NBT2 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SPC24Q8NBT2 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SPC24Q8NBT2 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SPC24Q8NBT2 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SPC24Q8NBT2 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SPC24Q8NBT2 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPC24Q8NBT2 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPC24Q8NBT2 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPC24Q8NBT2 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SPC24Q8NBT2 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPC24Q8NBT2 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPC24Q8NBT2 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPC24Q8NBT2 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPC24Q8NBT2 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPC24Q8NBT2 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPC24Q8NBT2 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SPC24Q8NBT2 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SPC24Q8NBT2 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SPC24Q8NBT2 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SPC24Q8NBT2 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SPC24Q8NBT2 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SPC24Q8NBT2 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SPC24Q8NBT2 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SPC24Q8NBT2 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SPC24Q8NBT2 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SPC24Q8NBT2 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SPC24Q8NBT2 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SPC24Q8NBT2 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SPC24Q8NBT2 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SPC24Q8NBT2 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SPC24Q8NBT2 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SPC24Q8NBT2 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SPC24Q8NBT2 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SPC24Q8NBT2 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SPC24Q8NBT2 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SPC24Q8NBT2 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SPC24Q8NBT2 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SPC24Q8NBT2 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SPC24Q8NBT2 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SPC24Q8NBT2 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SPC24Q8NBT2 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SPC24Q8NBT2 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SPC24Q8NBT2 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SPC24Q8NBT2 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SPC24Q8NBT2 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SPC24Q8NBT2 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SPC24Q8NBT2 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SPC24Q8NBT2 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SPC24Q8NBT2 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SPC24Q8NBT2 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SPC24Q8NBT2 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SPC24Q8NBT2 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SPC24Q8NBT2 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SPC24Q8NBT2 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SPC24Q8NBT2 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SPC24Q8NBT2 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SPC24Q8NBT2 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SPC24Q8NBT2 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SPC24Q8NBT2 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SPC24Q8NBT2 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SPC24Q8NBT2 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SPC24Q8NBT2 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SPC24Q8NBT2 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SPC24Q8NBT2 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SPC24Q8NBT2 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SPC24Q8NBT2 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SPC24Q8NBT2 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SPC24Q8NBT2 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SPC24Q8NBT2 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SPC24Q8NBT2 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SPC24Q8NBT2 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SPC24Q8NBT2 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SPC24Q8NBT2 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SPC24Q8NBT2 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SPC24Q8NBT2 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SPC24Q8NBT2 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SPC24Q8NBT2 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SPC24Q8NBT2 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SPC24Q8NBT2 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SPC24Q8NBT2 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SPC24Q8NBT2 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SPC24Q8NBT2 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SPC24Q8NBT2 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms