Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBN3

TMEM87A, Transmembrane protein 87A, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM87AQ8NBN3 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TMEM87AQ8NBN3 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TMEM87AQ8NBN3 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMEM87AQ8NBN3 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMEM87AQ8NBN3 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMEM87AQ8NBN3 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMEM87AQ8NBN3 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMEM87AQ8NBN3 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMEM87AQ8NBN3 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMEM87AQ8NBN3 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMEM87AQ8NBN3 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMEM87AQ8NBN3 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMEM87AQ8NBN3 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMEM87AQ8NBN3 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMEM87AQ8NBN3 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMEM87AQ8NBN3 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMEM87AQ8NBN3 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
TMEM87AQ8NBN3 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
TMEM87AQ8NBN3 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TMEM87AQ8NBN3 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TMEM87AQ8NBN3 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TMEM87AQ8NBN3 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TMEM87AQ8NBN3 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TMEM87AQ8NBN3 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMEM87AQ8NBN3 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMEM87AQ8NBN3 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMEM87AQ8NBN3 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMEM87AQ8NBN3 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMEM87AQ8NBN3 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMEM87AQ8NBN3 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMEM87AQ8NBN3 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMEM87AQ8NBN3 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMEM87AQ8NBN3 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMEM87AQ8NBN3 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMEM87AQ8NBN3 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMEM87AQ8NBN3 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMEM87AQ8NBN3 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMEM87AQ8NBN3 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
TMEM87AQ8NBN3 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMEM87AQ8NBN3 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMEM87AQ8NBN3 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMEM87AQ8NBN3 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMEM87AQ8NBN3 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMEM87AQ8NBN3 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMEM87AQ8NBN3 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMEM87AQ8NBN3 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMEM87AQ8NBN3 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMEM87AQ8NBN3 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMEM87AQ8NBN3 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMEM87AQ8NBN3 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMEM87AQ8NBN3 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMEM87AQ8NBN3 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMEM87AQ8NBN3 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMEM87AQ8NBN3 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMEM87AQ8NBN3 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMEM87AQ8NBN3 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMEM87AQ8NBN3 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMEM87AQ8NBN3 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMEM87AQ8NBN3 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMEM87AQ8NBN3 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMEM87AQ8NBN3 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMEM87AQ8NBN3 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMEM87AQ8NBN3 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMEM87AQ8NBN3 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMEM87AQ8NBN3 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMEM87AQ8NBN3 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMEM87AQ8NBN3 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
TMEM87AQ8NBN3 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMEM87AQ8NBN3 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMEM87AQ8NBN3 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMEM87AQ8NBN3 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TMEM87AQ8NBN3 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TMEM87AQ8NBN3 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
TMEM87AQ8NBN3 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TMEM87AQ8NBN3 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TMEM87AQ8NBN3 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TMEM87AQ8NBN3 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TMEM87AQ8NBN3 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TMEM87AQ8NBN3 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
TMEM87AQ8NBN3 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TMEM87AQ8NBN3 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TMEM87AQ8NBN3 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TMEM87AQ8NBN3 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
TMEM87AQ8NBN3 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TMEM87AQ8NBN3 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TMEM87AQ8NBN3 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMEM87AQ8NBN3 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMEM87AQ8NBN3 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMEM87AQ8NBN3 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMEM87AQ8NBN3 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMEM87AQ8NBN3 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMEM87AQ8NBN3 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMEM87AQ8NBN3 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMEM87AQ8NBN3 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMEM87AQ8NBN3 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
TMEM87AQ8NBN3 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMEM87AQ8NBN3 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMEM87AQ8NBN3 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMEM87AQ8NBN3 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMEM87AQ8NBN3 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms