Protein–RNA interactions for Protein: Q8NB14

USP38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, humanhuman

Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP38Q8NB14 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP38Q8NB14 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP38Q8NB14 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP38Q8NB14 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP38Q8NB14 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP38Q8NB14 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP38Q8NB14 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP38Q8NB14 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP38Q8NB14 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP38Q8NB14 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP38Q8NB14 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP38Q8NB14 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP38Q8NB14 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP38Q8NB14 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP38Q8NB14 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP38Q8NB14 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP38Q8NB14 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP38Q8NB14 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP38Q8NB14 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP38Q8NB14 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP38Q8NB14 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP38Q8NB14 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP38Q8NB14 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP38Q8NB14 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP38Q8NB14 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP38Q8NB14 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP38Q8NB14 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP38Q8NB14 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
USP38Q8NB14 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP38Q8NB14 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP38Q8NB14 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP38Q8NB14 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP38Q8NB14 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP38Q8NB14 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP38Q8NB14 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP38Q8NB14 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP38Q8NB14 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP38Q8NB14 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP38Q8NB14 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP38Q8NB14 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
USP38Q8NB14 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP38Q8NB14 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP38Q8NB14 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
USP38Q8NB14 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP38Q8NB14 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP38Q8NB14 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP38Q8NB14 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP38Q8NB14 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP38Q8NB14 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP38Q8NB14 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP38Q8NB14 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP38Q8NB14 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP38Q8NB14 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
USP38Q8NB14 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP38Q8NB14 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP38Q8NB14 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP38Q8NB14 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP38Q8NB14 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP38Q8NB14 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP38Q8NB14 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP38Q8NB14 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP38Q8NB14 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP38Q8NB14 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP38Q8NB14 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP38Q8NB14 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP38Q8NB14 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
USP38Q8NB14 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP38Q8NB14 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP38Q8NB14 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
USP38Q8NB14 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP38Q8NB14 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP38Q8NB14 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP38Q8NB14 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP38Q8NB14 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP38Q8NB14 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP38Q8NB14 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP38Q8NB14 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP38Q8NB14 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP38Q8NB14 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP38Q8NB14 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP38Q8NB14 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP38Q8NB14 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP38Q8NB14 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP38Q8NB14 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP38Q8NB14 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP38Q8NB14 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP38Q8NB14 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP38Q8NB14 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP38Q8NB14 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP38Q8NB14 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP38Q8NB14 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP38Q8NB14 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP38Q8NB14 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP38Q8NB14 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP38Q8NB14 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
USP38Q8NB14 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP38Q8NB14 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP38Q8NB14 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP38Q8NB14 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
USP38Q8NB14 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms