Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAV1

PRPF38A, Pre-mRNA-splicing factor 38A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF38AQ8NAV1 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRPF38AQ8NAV1 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRPF38AQ8NAV1 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRPF38AQ8NAV1 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRPF38AQ8NAV1 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRPF38AQ8NAV1 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRPF38AQ8NAV1 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRPF38AQ8NAV1 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRPF38AQ8NAV1 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRPF38AQ8NAV1 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRPF38AQ8NAV1 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRPF38AQ8NAV1 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRPF38AQ8NAV1 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRPF38AQ8NAV1 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRPF38AQ8NAV1 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRPF38AQ8NAV1 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRPF38AQ8NAV1 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRPF38AQ8NAV1 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
PRPF38AQ8NAV1 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRPF38AQ8NAV1 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRPF38AQ8NAV1 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRPF38AQ8NAV1 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRPF38AQ8NAV1 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRPF38AQ8NAV1 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRPF38AQ8NAV1 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRPF38AQ8NAV1 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRPF38AQ8NAV1 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRPF38AQ8NAV1 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRPF38AQ8NAV1 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRPF38AQ8NAV1 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PRPF38AQ8NAV1 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
PRPF38AQ8NAV1 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRPF38AQ8NAV1 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRPF38AQ8NAV1 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRPF38AQ8NAV1 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRPF38AQ8NAV1 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRPF38AQ8NAV1 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRPF38AQ8NAV1 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRPF38AQ8NAV1 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRPF38AQ8NAV1 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRPF38AQ8NAV1 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRPF38AQ8NAV1 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRPF38AQ8NAV1 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRPF38AQ8NAV1 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRPF38AQ8NAV1 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRPF38AQ8NAV1 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRPF38AQ8NAV1 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRPF38AQ8NAV1 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRPF38AQ8NAV1 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRPF38AQ8NAV1 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRPF38AQ8NAV1 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRPF38AQ8NAV1 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRPF38AQ8NAV1 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRPF38AQ8NAV1 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRPF38AQ8NAV1 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
PRPF38AQ8NAV1 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRPF38AQ8NAV1 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRPF38AQ8NAV1 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRPF38AQ8NAV1 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRPF38AQ8NAV1 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRPF38AQ8NAV1 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
PRPF38AQ8NAV1 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
PRPF38AQ8NAV1 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRPF38AQ8NAV1 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRPF38AQ8NAV1 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRPF38AQ8NAV1 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRPF38AQ8NAV1 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRPF38AQ8NAV1 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRPF38AQ8NAV1 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRPF38AQ8NAV1 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRPF38AQ8NAV1 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRPF38AQ8NAV1 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRPF38AQ8NAV1 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRPF38AQ8NAV1 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRPF38AQ8NAV1 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRPF38AQ8NAV1 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
PRPF38AQ8NAV1 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRPF38AQ8NAV1 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRPF38AQ8NAV1 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRPF38AQ8NAV1 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRPF38AQ8NAV1 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRPF38AQ8NAV1 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRPF38AQ8NAV1 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRPF38AQ8NAV1 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRPF38AQ8NAV1 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRPF38AQ8NAV1 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRPF38AQ8NAV1 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRPF38AQ8NAV1 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRPF38AQ8NAV1 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRPF38AQ8NAV1 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRPF38AQ8NAV1 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRPF38AQ8NAV1 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PRPF38AQ8NAV1 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PRPF38AQ8NAV1 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PRPF38AQ8NAV1 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PRPF38AQ8NAV1 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PRPF38AQ8NAV1 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PRPF38AQ8NAV1 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PRPF38AQ8NAV1 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PRPF38AQ8NAV1 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms