Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA03

FSIP1, Fibrous sheath-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSIP1Q8NA03 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FSIP1Q8NA03 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FSIP1Q8NA03 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FSIP1Q8NA03 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FSIP1Q8NA03 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FSIP1Q8NA03 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FSIP1Q8NA03 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FSIP1Q8NA03 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FSIP1Q8NA03 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FSIP1Q8NA03 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
FSIP1Q8NA03 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FSIP1Q8NA03 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FSIP1Q8NA03 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FSIP1Q8NA03 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FSIP1Q8NA03 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
FSIP1Q8NA03 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
FSIP1Q8NA03 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
FSIP1Q8NA03 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC25■■□□□ 1.59
FSIP1Q8NA03 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
FSIP1Q8NA03 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25■■□□□ 1.59
FSIP1Q8NA03 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
FSIP1Q8NA03 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC25■■□□□ 1.59
FSIP1Q8NA03 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FSIP1Q8NA03 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FSIP1Q8NA03 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
FSIP1Q8NA03 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
FSIP1Q8NA03 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
FSIP1Q8NA03 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
FSIP1Q8NA03 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
FSIP1Q8NA03 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
FSIP1Q8NA03 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FSIP1Q8NA03 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FSIP1Q8NA03 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FSIP1Q8NA03 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FSIP1Q8NA03 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FSIP1Q8NA03 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FSIP1Q8NA03 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FSIP1Q8NA03 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FSIP1Q8NA03 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FSIP1Q8NA03 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FSIP1Q8NA03 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FSIP1Q8NA03 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FSIP1Q8NA03 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FSIP1Q8NA03 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FSIP1Q8NA03 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FSIP1Q8NA03 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FSIP1Q8NA03 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
FSIP1Q8NA03 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
FSIP1Q8NA03 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
FSIP1Q8NA03 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FSIP1Q8NA03 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FSIP1Q8NA03 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FSIP1Q8NA03 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FSIP1Q8NA03 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FSIP1Q8NA03 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FSIP1Q8NA03 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FSIP1Q8NA03 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FSIP1Q8NA03 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FSIP1Q8NA03 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
FSIP1Q8NA03 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
FSIP1Q8NA03 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FSIP1Q8NA03 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FSIP1Q8NA03 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FSIP1Q8NA03 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FSIP1Q8NA03 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FSIP1Q8NA03 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FSIP1Q8NA03 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
FSIP1Q8NA03 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
FSIP1Q8NA03 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
FSIP1Q8NA03 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
FSIP1Q8NA03 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
FSIP1Q8NA03 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
FSIP1Q8NA03 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
FSIP1Q8NA03 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FSIP1Q8NA03 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
FSIP1Q8NA03 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FSIP1Q8NA03 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
FSIP1Q8NA03 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FSIP1Q8NA03 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
FSIP1Q8NA03 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
FSIP1Q8NA03 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
FSIP1Q8NA03 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FSIP1Q8NA03 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
FSIP1Q8NA03 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FSIP1Q8NA03 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FSIP1Q8NA03 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FSIP1Q8NA03 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FSIP1Q8NA03 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FSIP1Q8NA03 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
FSIP1Q8NA03 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FSIP1Q8NA03 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
FSIP1Q8NA03 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FSIP1Q8NA03 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FSIP1Q8NA03 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FSIP1Q8NA03 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
FSIP1Q8NA03 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FSIP1Q8NA03 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FSIP1Q8NA03 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
FSIP1Q8NA03 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
FSIP1Q8NA03 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms