Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9V6

ANKRD53, Ankyrin repeat domain-containing protein 53, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD53Q8N9V6 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
ANKRD53Q8N9V6 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ANKRD53Q8N9V6 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ANKRD53Q8N9V6 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ANKRD53Q8N9V6 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ANKRD53Q8N9V6 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ANKRD53Q8N9V6 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ANKRD53Q8N9V6 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ANKRD53Q8N9V6 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ANKRD53Q8N9V6 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ANKRD53Q8N9V6 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
ANKRD53Q8N9V6 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
ANKRD53Q8N9V6 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
ANKRD53Q8N9V6 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ANKRD53Q8N9V6 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ANKRD53Q8N9V6 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ANKRD53Q8N9V6 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ANKRD53Q8N9V6 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ANKRD53Q8N9V6 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ANKRD53Q8N9V6 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ANKRD53Q8N9V6 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ANKRD53Q8N9V6 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ANKRD53Q8N9V6 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ANKRD53Q8N9V6 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ANKRD53Q8N9V6 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ANKRD53Q8N9V6 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ANKRD53Q8N9V6 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ANKRD53Q8N9V6 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
ANKRD53Q8N9V6 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ANKRD53Q8N9V6 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ANKRD53Q8N9V6 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ANKRD53Q8N9V6 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ANKRD53Q8N9V6 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ANKRD53Q8N9V6 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ANKRD53Q8N9V6 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ANKRD53Q8N9V6 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
ANKRD53Q8N9V6 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
ANKRD53Q8N9V6 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ANKRD53Q8N9V6 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ANKRD53Q8N9V6 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ANKRD53Q8N9V6 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ANKRD53Q8N9V6 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ANKRD53Q8N9V6 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
ANKRD53Q8N9V6 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ANKRD53Q8N9V6 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ANKRD53Q8N9V6 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ANKRD53Q8N9V6 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ANKRD53Q8N9V6 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ANKRD53Q8N9V6 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ANKRD53Q8N9V6 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ANKRD53Q8N9V6 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ANKRD53Q8N9V6 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ANKRD53Q8N9V6 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ANKRD53Q8N9V6 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ANKRD53Q8N9V6 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ANKRD53Q8N9V6 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ANKRD53Q8N9V6 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ANKRD53Q8N9V6 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ANKRD53Q8N9V6 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ANKRD53Q8N9V6 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ANKRD53Q8N9V6 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ANKRD53Q8N9V6 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ANKRD53Q8N9V6 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ANKRD53Q8N9V6 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ANKRD53Q8N9V6 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ANKRD53Q8N9V6 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
ANKRD53Q8N9V6 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ANKRD53Q8N9V6 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ANKRD53Q8N9V6 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
ANKRD53Q8N9V6 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
ANKRD53Q8N9V6 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ANKRD53Q8N9V6 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ANKRD53Q8N9V6 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ANKRD53Q8N9V6 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ANKRD53Q8N9V6 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ANKRD53Q8N9V6 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ANKRD53Q8N9V6 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
ANKRD53Q8N9V6 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ANKRD53Q8N9V6 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ANKRD53Q8N9V6 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ANKRD53Q8N9V6 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ANKRD53Q8N9V6 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ANKRD53Q8N9V6 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ANKRD53Q8N9V6 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ANKRD53Q8N9V6 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ANKRD53Q8N9V6 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ANKRD53Q8N9V6 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ANKRD53Q8N9V6 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ANKRD53Q8N9V6 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21■□□□□ 0.95
ANKRD53Q8N9V6 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
ANKRD53Q8N9V6 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ANKRD53Q8N9V6 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ANKRD53Q8N9V6 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21■□□□□ 0.95
ANKRD53Q8N9V6 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21■□□□□ 0.95
ANKRD53Q8N9V6 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ANKRD53Q8N9V6 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ANKRD53Q8N9V6 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ANKRD53Q8N9V6 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ANKRD53Q8N9V6 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ANKRD53Q8N9V6 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms