Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9B4

ANKRD42, Ankyrin repeat domain-containing protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD42Q8N9B4 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ANKRD42Q8N9B4 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ANKRD42Q8N9B4 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ANKRD42Q8N9B4 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ANKRD42Q8N9B4 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ANKRD42Q8N9B4 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ANKRD42Q8N9B4 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ANKRD42Q8N9B4 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ANKRD42Q8N9B4 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ANKRD42Q8N9B4 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ANKRD42Q8N9B4 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ANKRD42Q8N9B4 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ANKRD42Q8N9B4 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ANKRD42Q8N9B4 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ANKRD42Q8N9B4 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ANKRD42Q8N9B4 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ANKRD42Q8N9B4 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ANKRD42Q8N9B4 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ANKRD42Q8N9B4 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ANKRD42Q8N9B4 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ANKRD42Q8N9B4 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ANKRD42Q8N9B4 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ANKRD42Q8N9B4 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ANKRD42Q8N9B4 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ANKRD42Q8N9B4 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ANKRD42Q8N9B4 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ANKRD42Q8N9B4 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ANKRD42Q8N9B4 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ANKRD42Q8N9B4 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ANKRD42Q8N9B4 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ANKRD42Q8N9B4 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ANKRD42Q8N9B4 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ANKRD42Q8N9B4 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ANKRD42Q8N9B4 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ANKRD42Q8N9B4 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ANKRD42Q8N9B4 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ANKRD42Q8N9B4 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ANKRD42Q8N9B4 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ANKRD42Q8N9B4 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ANKRD42Q8N9B4 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ANKRD42Q8N9B4 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ANKRD42Q8N9B4 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ANKRD42Q8N9B4 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ANKRD42Q8N9B4 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ANKRD42Q8N9B4 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ANKRD42Q8N9B4 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ANKRD42Q8N9B4 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ANKRD42Q8N9B4 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ANKRD42Q8N9B4 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ANKRD42Q8N9B4 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ANKRD42Q8N9B4 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ANKRD42Q8N9B4 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ANKRD42Q8N9B4 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ANKRD42Q8N9B4 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ANKRD42Q8N9B4 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ANKRD42Q8N9B4 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ANKRD42Q8N9B4 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ANKRD42Q8N9B4 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ANKRD42Q8N9B4 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ANKRD42Q8N9B4 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ANKRD42Q8N9B4 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ANKRD42Q8N9B4 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ANKRD42Q8N9B4 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ANKRD42Q8N9B4 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ANKRD42Q8N9B4 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ANKRD42Q8N9B4 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ANKRD42Q8N9B4 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ANKRD42Q8N9B4 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ANKRD42Q8N9B4 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ANKRD42Q8N9B4 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ANKRD42Q8N9B4 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ANKRD42Q8N9B4 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ANKRD42Q8N9B4 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ANKRD42Q8N9B4 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ANKRD42Q8N9B4 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ANKRD42Q8N9B4 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ANKRD42Q8N9B4 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ANKRD42Q8N9B4 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ANKRD42Q8N9B4 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ANKRD42Q8N9B4 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ANKRD42Q8N9B4 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ANKRD42Q8N9B4 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ANKRD42Q8N9B4 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ANKRD42Q8N9B4 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ANKRD42Q8N9B4 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ANKRD42Q8N9B4 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ANKRD42Q8N9B4 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ANKRD42Q8N9B4 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ANKRD42Q8N9B4 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ANKRD42Q8N9B4 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ANKRD42Q8N9B4 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ANKRD42Q8N9B4 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ANKRD42Q8N9B4 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ANKRD42Q8N9B4 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ANKRD42Q8N9B4 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ANKRD42Q8N9B4 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ANKRD42Q8N9B4 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ANKRD42Q8N9B4 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ANKRD42Q8N9B4 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ANKRD42Q8N9B4 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms