Protein–RNA interactions for Protein: Q8N7H5

PAF1, RNA polymerase II-associated factor 1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAF1Q8N7H5 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PAF1Q8N7H5 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PAF1Q8N7H5 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PAF1Q8N7H5 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PAF1Q8N7H5 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PAF1Q8N7H5 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PAF1Q8N7H5 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PAF1Q8N7H5 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PAF1Q8N7H5 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PAF1Q8N7H5 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PAF1Q8N7H5 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PAF1Q8N7H5 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PAF1Q8N7H5 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PAF1Q8N7H5 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PAF1Q8N7H5 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PAF1Q8N7H5 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PAF1Q8N7H5 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PAF1Q8N7H5 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PAF1Q8N7H5 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PAF1Q8N7H5 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PAF1Q8N7H5 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PAF1Q8N7H5 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PAF1Q8N7H5 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PAF1Q8N7H5 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PAF1Q8N7H5 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PAF1Q8N7H5 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PAF1Q8N7H5 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PAF1Q8N7H5 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PAF1Q8N7H5 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PAF1Q8N7H5 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PAF1Q8N7H5 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PAF1Q8N7H5 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PAF1Q8N7H5 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PAF1Q8N7H5 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PAF1Q8N7H5 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PAF1Q8N7H5 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PAF1Q8N7H5 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PAF1Q8N7H5 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PAF1Q8N7H5 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PAF1Q8N7H5 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PAF1Q8N7H5 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PAF1Q8N7H5 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PAF1Q8N7H5 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PAF1Q8N7H5 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PAF1Q8N7H5 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PAF1Q8N7H5 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PAF1Q8N7H5 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PAF1Q8N7H5 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PAF1Q8N7H5 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PAF1Q8N7H5 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PAF1Q8N7H5 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PAF1Q8N7H5 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PAF1Q8N7H5 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PAF1Q8N7H5 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PAF1Q8N7H5 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PAF1Q8N7H5 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PAF1Q8N7H5 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PAF1Q8N7H5 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PAF1Q8N7H5 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PAF1Q8N7H5 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PAF1Q8N7H5 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PAF1Q8N7H5 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PAF1Q8N7H5 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PAF1Q8N7H5 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PAF1Q8N7H5 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PAF1Q8N7H5 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PAF1Q8N7H5 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PAF1Q8N7H5 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PAF1Q8N7H5 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PAF1Q8N7H5 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PAF1Q8N7H5 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PAF1Q8N7H5 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PAF1Q8N7H5 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PAF1Q8N7H5 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PAF1Q8N7H5 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PAF1Q8N7H5 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PAF1Q8N7H5 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PAF1Q8N7H5 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PAF1Q8N7H5 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PAF1Q8N7H5 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PAF1Q8N7H5 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PAF1Q8N7H5 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PAF1Q8N7H5 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PAF1Q8N7H5 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PAF1Q8N7H5 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PAF1Q8N7H5 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PAF1Q8N7H5 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PAF1Q8N7H5 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PAF1Q8N7H5 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PAF1Q8N7H5 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PAF1Q8N7H5 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PAF1Q8N7H5 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PAF1Q8N7H5 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PAF1Q8N7H5 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PAF1Q8N7H5 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PAF1Q8N7H5 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PAF1Q8N7H5 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PAF1Q8N7H5 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PAF1Q8N7H5 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PAF1Q8N7H5 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms