Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5G0

SMIM20, Small integral membrane protein 20, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM20Q8N5G0 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SMIM20Q8N5G0 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SMIM20Q8N5G0 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SMIM20Q8N5G0 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SMIM20Q8N5G0 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SMIM20Q8N5G0 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SMIM20Q8N5G0 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SMIM20Q8N5G0 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SMIM20Q8N5G0 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SMIM20Q8N5G0 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SMIM20Q8N5G0 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SMIM20Q8N5G0 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SMIM20Q8N5G0 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SMIM20Q8N5G0 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SMIM20Q8N5G0 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SMIM20Q8N5G0 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SMIM20Q8N5G0 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SMIM20Q8N5G0 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SMIM20Q8N5G0 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SMIM20Q8N5G0 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SMIM20Q8N5G0 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SMIM20Q8N5G0 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SMIM20Q8N5G0 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SMIM20Q8N5G0 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SMIM20Q8N5G0 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
SMIM20Q8N5G0 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SMIM20Q8N5G0 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SMIM20Q8N5G0 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SMIM20Q8N5G0 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SMIM20Q8N5G0 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SMIM20Q8N5G0 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SMIM20Q8N5G0 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SMIM20Q8N5G0 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SMIM20Q8N5G0 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SMIM20Q8N5G0 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SMIM20Q8N5G0 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SMIM20Q8N5G0 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SMIM20Q8N5G0 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SMIM20Q8N5G0 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SMIM20Q8N5G0 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SMIM20Q8N5G0 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SMIM20Q8N5G0 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SMIM20Q8N5G0 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SMIM20Q8N5G0 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SMIM20Q8N5G0 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SMIM20Q8N5G0 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SMIM20Q8N5G0 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SMIM20Q8N5G0 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SMIM20Q8N5G0 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SMIM20Q8N5G0 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SMIM20Q8N5G0 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SMIM20Q8N5G0 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SMIM20Q8N5G0 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SMIM20Q8N5G0 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SMIM20Q8N5G0 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SMIM20Q8N5G0 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SMIM20Q8N5G0 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SMIM20Q8N5G0 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SMIM20Q8N5G0 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SMIM20Q8N5G0 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SMIM20Q8N5G0 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SMIM20Q8N5G0 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SMIM20Q8N5G0 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SMIM20Q8N5G0 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SMIM20Q8N5G0 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SMIM20Q8N5G0 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SMIM20Q8N5G0 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SMIM20Q8N5G0 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SMIM20Q8N5G0 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SMIM20Q8N5G0 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SMIM20Q8N5G0 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SMIM20Q8N5G0 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SMIM20Q8N5G0 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SMIM20Q8N5G0 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SMIM20Q8N5G0 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SMIM20Q8N5G0 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SMIM20Q8N5G0 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SMIM20Q8N5G0 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
SMIM20Q8N5G0 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SMIM20Q8N5G0 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SMIM20Q8N5G0 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SMIM20Q8N5G0 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SMIM20Q8N5G0 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SMIM20Q8N5G0 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SMIM20Q8N5G0 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SMIM20Q8N5G0 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SMIM20Q8N5G0 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SMIM20Q8N5G0 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SMIM20Q8N5G0 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SMIM20Q8N5G0 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SMIM20Q8N5G0 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
SMIM20Q8N5G0 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
SMIM20Q8N5G0 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
SMIM20Q8N5G0 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
SMIM20Q8N5G0 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SMIM20Q8N5G0 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SMIM20Q8N5G0 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SMIM20Q8N5G0 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SMIM20Q8N5G0 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SMIM20Q8N5G0 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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