Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4Y2

CRACR2B, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRACR2BQ8N4Y2 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CRACR2BQ8N4Y2 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CRACR2BQ8N4Y2 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CRACR2BQ8N4Y2 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CRACR2BQ8N4Y2 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CRACR2BQ8N4Y2 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CRACR2BQ8N4Y2 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CRACR2BQ8N4Y2 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
CRACR2BQ8N4Y2 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CRACR2BQ8N4Y2 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CRACR2BQ8N4Y2 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CRACR2BQ8N4Y2 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CRACR2BQ8N4Y2 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CRACR2BQ8N4Y2 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CRACR2BQ8N4Y2 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CRACR2BQ8N4Y2 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CRACR2BQ8N4Y2 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CRACR2BQ8N4Y2 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CRACR2BQ8N4Y2 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CRACR2BQ8N4Y2 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CRACR2BQ8N4Y2 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CRACR2BQ8N4Y2 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CRACR2BQ8N4Y2 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CRACR2BQ8N4Y2 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CRACR2BQ8N4Y2 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CRACR2BQ8N4Y2 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
CRACR2BQ8N4Y2 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CRACR2BQ8N4Y2 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CRACR2BQ8N4Y2 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CRACR2BQ8N4Y2 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CRACR2BQ8N4Y2 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CRACR2BQ8N4Y2 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
CRACR2BQ8N4Y2 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CRACR2BQ8N4Y2 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
CRACR2BQ8N4Y2 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
CRACR2BQ8N4Y2 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
CRACR2BQ8N4Y2 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
CRACR2BQ8N4Y2 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
CRACR2BQ8N4Y2 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
CRACR2BQ8N4Y2 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CRACR2BQ8N4Y2 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CRACR2BQ8N4Y2 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CRACR2BQ8N4Y2 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CRACR2BQ8N4Y2 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CRACR2BQ8N4Y2 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CRACR2BQ8N4Y2 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CRACR2BQ8N4Y2 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CRACR2BQ8N4Y2 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CRACR2BQ8N4Y2 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CRACR2BQ8N4Y2 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CRACR2BQ8N4Y2 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
CRACR2BQ8N4Y2 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CRACR2BQ8N4Y2 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CRACR2BQ8N4Y2 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CRACR2BQ8N4Y2 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CRACR2BQ8N4Y2 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CRACR2BQ8N4Y2 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CRACR2BQ8N4Y2 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CRACR2BQ8N4Y2 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CRACR2BQ8N4Y2 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CRACR2BQ8N4Y2 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CRACR2BQ8N4Y2 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
CRACR2BQ8N4Y2 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CRACR2BQ8N4Y2 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CRACR2BQ8N4Y2 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CRACR2BQ8N4Y2 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CRACR2BQ8N4Y2 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CRACR2BQ8N4Y2 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CRACR2BQ8N4Y2 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CRACR2BQ8N4Y2 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CRACR2BQ8N4Y2 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
CRACR2BQ8N4Y2 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CRACR2BQ8N4Y2 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CRACR2BQ8N4Y2 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CRACR2BQ8N4Y2 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CRACR2BQ8N4Y2 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CRACR2BQ8N4Y2 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CRACR2BQ8N4Y2 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CRACR2BQ8N4Y2 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CRACR2BQ8N4Y2 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CRACR2BQ8N4Y2 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CRACR2BQ8N4Y2 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CRACR2BQ8N4Y2 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CRACR2BQ8N4Y2 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CRACR2BQ8N4Y2 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CRACR2BQ8N4Y2 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CRACR2BQ8N4Y2 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CRACR2BQ8N4Y2 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CRACR2BQ8N4Y2 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CRACR2BQ8N4Y2 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
CRACR2BQ8N4Y2 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CRACR2BQ8N4Y2 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CRACR2BQ8N4Y2 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CRACR2BQ8N4Y2 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CRACR2BQ8N4Y2 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CRACR2BQ8N4Y2 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CRACR2BQ8N4Y2 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CRACR2BQ8N4Y2 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CRACR2BQ8N4Y2 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CRACR2BQ8N4Y2 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms