Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3S3

PHTF2, Putative homeodomain transcription factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHTF2Q8N3S3 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PHTF2Q8N3S3 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PHTF2Q8N3S3 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PHTF2Q8N3S3 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PHTF2Q8N3S3 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PHTF2Q8N3S3 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PHTF2Q8N3S3 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PHTF2Q8N3S3 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PHTF2Q8N3S3 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PHTF2Q8N3S3 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PHTF2Q8N3S3 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PHTF2Q8N3S3 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PHTF2Q8N3S3 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PHTF2Q8N3S3 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PHTF2Q8N3S3 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PHTF2Q8N3S3 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PHTF2Q8N3S3 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PHTF2Q8N3S3 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PHTF2Q8N3S3 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PHTF2Q8N3S3 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PHTF2Q8N3S3 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PHTF2Q8N3S3 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PHTF2Q8N3S3 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PHTF2Q8N3S3 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PHTF2Q8N3S3 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PHTF2Q8N3S3 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PHTF2Q8N3S3 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PHTF2Q8N3S3 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PHTF2Q8N3S3 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PHTF2Q8N3S3 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PHTF2Q8N3S3 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PHTF2Q8N3S3 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PHTF2Q8N3S3 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PHTF2Q8N3S3 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PHTF2Q8N3S3 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PHTF2Q8N3S3 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PHTF2Q8N3S3 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PHTF2Q8N3S3 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PHTF2Q8N3S3 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PHTF2Q8N3S3 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PHTF2Q8N3S3 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PHTF2Q8N3S3 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PHTF2Q8N3S3 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PHTF2Q8N3S3 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PHTF2Q8N3S3 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PHTF2Q8N3S3 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PHTF2Q8N3S3 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PHTF2Q8N3S3 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PHTF2Q8N3S3 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PHTF2Q8N3S3 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PHTF2Q8N3S3 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PHTF2Q8N3S3 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PHTF2Q8N3S3 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PHTF2Q8N3S3 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PHTF2Q8N3S3 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PHTF2Q8N3S3 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PHTF2Q8N3S3 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PHTF2Q8N3S3 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PHTF2Q8N3S3 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PHTF2Q8N3S3 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PHTF2Q8N3S3 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PHTF2Q8N3S3 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PHTF2Q8N3S3 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PHTF2Q8N3S3 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PHTF2Q8N3S3 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PHTF2Q8N3S3 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PHTF2Q8N3S3 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PHTF2Q8N3S3 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PHTF2Q8N3S3 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PHTF2Q8N3S3 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PHTF2Q8N3S3 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PHTF2Q8N3S3 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PHTF2Q8N3S3 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PHTF2Q8N3S3 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PHTF2Q8N3S3 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PHTF2Q8N3S3 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PHTF2Q8N3S3 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PHTF2Q8N3S3 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PHTF2Q8N3S3 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PHTF2Q8N3S3 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PHTF2Q8N3S3 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PHTF2Q8N3S3 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PHTF2Q8N3S3 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PHTF2Q8N3S3 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PHTF2Q8N3S3 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PHTF2Q8N3S3 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PHTF2Q8N3S3 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PHTF2Q8N3S3 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PHTF2Q8N3S3 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PHTF2Q8N3S3 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PHTF2Q8N3S3 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PHTF2Q8N3S3 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PHTF2Q8N3S3 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PHTF2Q8N3S3 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PHTF2Q8N3S3 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PHTF2Q8N3S3 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PHTF2Q8N3S3 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PHTF2Q8N3S3 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PHTF2Q8N3S3 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PHTF2Q8N3S3 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms