Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW0

LMNTD2, Lamin tail domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNTD2Q8IXW0 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LMNTD2Q8IXW0 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LMNTD2Q8IXW0 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
LMNTD2Q8IXW0 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LMNTD2Q8IXW0 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LMNTD2Q8IXW0 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LMNTD2Q8IXW0 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LMNTD2Q8IXW0 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LMNTD2Q8IXW0 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LMNTD2Q8IXW0 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LMNTD2Q8IXW0 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
LMNTD2Q8IXW0 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LMNTD2Q8IXW0 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LMNTD2Q8IXW0 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LMNTD2Q8IXW0 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LMNTD2Q8IXW0 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LMNTD2Q8IXW0 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
LMNTD2Q8IXW0 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LMNTD2Q8IXW0 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LMNTD2Q8IXW0 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LMNTD2Q8IXW0 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LMNTD2Q8IXW0 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LMNTD2Q8IXW0 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LMNTD2Q8IXW0 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LMNTD2Q8IXW0 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LMNTD2Q8IXW0 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LMNTD2Q8IXW0 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LMNTD2Q8IXW0 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
LMNTD2Q8IXW0 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LMNTD2Q8IXW0 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LMNTD2Q8IXW0 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LMNTD2Q8IXW0 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LMNTD2Q8IXW0 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LMNTD2Q8IXW0 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LMNTD2Q8IXW0 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LMNTD2Q8IXW0 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LMNTD2Q8IXW0 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
LMNTD2Q8IXW0 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LMNTD2Q8IXW0 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LMNTD2Q8IXW0 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LMNTD2Q8IXW0 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LMNTD2Q8IXW0 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LMNTD2Q8IXW0 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LMNTD2Q8IXW0 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LMNTD2Q8IXW0 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LMNTD2Q8IXW0 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LMNTD2Q8IXW0 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LMNTD2Q8IXW0 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LMNTD2Q8IXW0 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LMNTD2Q8IXW0 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LMNTD2Q8IXW0 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LMNTD2Q8IXW0 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LMNTD2Q8IXW0 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LMNTD2Q8IXW0 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
LMNTD2Q8IXW0 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LMNTD2Q8IXW0 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LMNTD2Q8IXW0 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LMNTD2Q8IXW0 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
LMNTD2Q8IXW0 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LMNTD2Q8IXW0 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LMNTD2Q8IXW0 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LMNTD2Q8IXW0 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LMNTD2Q8IXW0 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LMNTD2Q8IXW0 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LMNTD2Q8IXW0 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LMNTD2Q8IXW0 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LMNTD2Q8IXW0 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LMNTD2Q8IXW0 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LMNTD2Q8IXW0 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LMNTD2Q8IXW0 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LMNTD2Q8IXW0 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LMNTD2Q8IXW0 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LMNTD2Q8IXW0 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LMNTD2Q8IXW0 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LMNTD2Q8IXW0 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LMNTD2Q8IXW0 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LMNTD2Q8IXW0 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LMNTD2Q8IXW0 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LMNTD2Q8IXW0 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LMNTD2Q8IXW0 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LMNTD2Q8IXW0 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LMNTD2Q8IXW0 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LMNTD2Q8IXW0 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LMNTD2Q8IXW0 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LMNTD2Q8IXW0 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LMNTD2Q8IXW0 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LMNTD2Q8IXW0 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LMNTD2Q8IXW0 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LMNTD2Q8IXW0 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LMNTD2Q8IXW0 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
LMNTD2Q8IXW0 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LMNTD2Q8IXW0 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LMNTD2Q8IXW0 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LMNTD2Q8IXW0 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LMNTD2Q8IXW0 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LMNTD2Q8IXW0 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LMNTD2Q8IXW0 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LMNTD2Q8IXW0 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LMNTD2Q8IXW0 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LMNTD2Q8IXW0 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms