Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV76

PASD1, Circadian clock protein PASD1, humanhuman

Predictions only

Length 773 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PASD1Q8IV76 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PASD1Q8IV76 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PASD1Q8IV76 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PASD1Q8IV76 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PASD1Q8IV76 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PASD1Q8IV76 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PASD1Q8IV76 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PASD1Q8IV76 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
PASD1Q8IV76 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PASD1Q8IV76 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PASD1Q8IV76 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PASD1Q8IV76 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PASD1Q8IV76 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PASD1Q8IV76 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PASD1Q8IV76 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PASD1Q8IV76 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PASD1Q8IV76 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PASD1Q8IV76 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PASD1Q8IV76 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PASD1Q8IV76 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PASD1Q8IV76 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PASD1Q8IV76 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PASD1Q8IV76 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PASD1Q8IV76 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PASD1Q8IV76 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PASD1Q8IV76 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PASD1Q8IV76 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PASD1Q8IV76 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PASD1Q8IV76 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PASD1Q8IV76 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PASD1Q8IV76 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PASD1Q8IV76 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PASD1Q8IV76 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PASD1Q8IV76 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PASD1Q8IV76 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PASD1Q8IV76 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PASD1Q8IV76 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PASD1Q8IV76 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PASD1Q8IV76 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PASD1Q8IV76 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PASD1Q8IV76 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PASD1Q8IV76 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PASD1Q8IV76 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PASD1Q8IV76 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PASD1Q8IV76 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PASD1Q8IV76 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PASD1Q8IV76 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PASD1Q8IV76 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PASD1Q8IV76 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PASD1Q8IV76 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PASD1Q8IV76 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PASD1Q8IV76 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PASD1Q8IV76 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PASD1Q8IV76 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PASD1Q8IV76 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PASD1Q8IV76 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PASD1Q8IV76 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PASD1Q8IV76 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PASD1Q8IV76 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PASD1Q8IV76 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PASD1Q8IV76 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PASD1Q8IV76 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PASD1Q8IV76 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PASD1Q8IV76 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PASD1Q8IV76 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PASD1Q8IV76 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PASD1Q8IV76 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PASD1Q8IV76 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PASD1Q8IV76 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PASD1Q8IV76 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PASD1Q8IV76 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PASD1Q8IV76 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PASD1Q8IV76 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PASD1Q8IV76 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PASD1Q8IV76 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PASD1Q8IV76 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PASD1Q8IV76 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PASD1Q8IV76 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PASD1Q8IV76 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PASD1Q8IV76 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PASD1Q8IV76 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PASD1Q8IV76 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PASD1Q8IV76 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PASD1Q8IV76 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PASD1Q8IV76 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PASD1Q8IV76 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PASD1Q8IV76 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PASD1Q8IV76 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PASD1Q8IV76 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PASD1Q8IV76 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PASD1Q8IV76 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PASD1Q8IV76 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PASD1Q8IV76 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PASD1Q8IV76 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PASD1Q8IV76 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PASD1Q8IV76 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PASD1Q8IV76 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PASD1Q8IV76 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PASD1Q8IV76 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PASD1Q8IV76 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms