Protein–RNA interactions for Protein: Q86WP2

GPBP1, Vasculin, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPBP1Q86WP2 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GPBP1Q86WP2 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GPBP1Q86WP2 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GPBP1Q86WP2 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GPBP1Q86WP2 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GPBP1Q86WP2 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GPBP1Q86WP2 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GPBP1Q86WP2 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GPBP1Q86WP2 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GPBP1Q86WP2 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GPBP1Q86WP2 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GPBP1Q86WP2 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GPBP1Q86WP2 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GPBP1Q86WP2 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GPBP1Q86WP2 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GPBP1Q86WP2 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
GPBP1Q86WP2 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GPBP1Q86WP2 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
GPBP1Q86WP2 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
GPBP1Q86WP2 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GPBP1Q86WP2 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GPBP1Q86WP2 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GPBP1Q86WP2 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GPBP1Q86WP2 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GPBP1Q86WP2 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GPBP1Q86WP2 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GPBP1Q86WP2 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GPBP1Q86WP2 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GPBP1Q86WP2 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GPBP1Q86WP2 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GPBP1Q86WP2 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GPBP1Q86WP2 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GPBP1Q86WP2 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GPBP1Q86WP2 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GPBP1Q86WP2 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GPBP1Q86WP2 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GPBP1Q86WP2 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GPBP1Q86WP2 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GPBP1Q86WP2 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
GPBP1Q86WP2 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
GPBP1Q86WP2 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GPBP1Q86WP2 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GPBP1Q86WP2 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GPBP1Q86WP2 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GPBP1Q86WP2 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
GPBP1Q86WP2 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
GPBP1Q86WP2 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GPBP1Q86WP2 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
GPBP1Q86WP2 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GPBP1Q86WP2 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
GPBP1Q86WP2 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
GPBP1Q86WP2 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GPBP1Q86WP2 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GPBP1Q86WP2 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GPBP1Q86WP2 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GPBP1Q86WP2 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GPBP1Q86WP2 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GPBP1Q86WP2 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GPBP1Q86WP2 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GPBP1Q86WP2 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GPBP1Q86WP2 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GPBP1Q86WP2 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GPBP1Q86WP2 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GPBP1Q86WP2 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GPBP1Q86WP2 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GPBP1Q86WP2 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GPBP1Q86WP2 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GPBP1Q86WP2 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GPBP1Q86WP2 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GPBP1Q86WP2 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GPBP1Q86WP2 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GPBP1Q86WP2 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GPBP1Q86WP2 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GPBP1Q86WP2 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GPBP1Q86WP2 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GPBP1Q86WP2 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GPBP1Q86WP2 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GPBP1Q86WP2 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GPBP1Q86WP2 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GPBP1Q86WP2 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GPBP1Q86WP2 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GPBP1Q86WP2 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GPBP1Q86WP2 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GPBP1Q86WP2 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GPBP1Q86WP2 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
GPBP1Q86WP2 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GPBP1Q86WP2 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GPBP1Q86WP2 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GPBP1Q86WP2 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GPBP1Q86WP2 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GPBP1Q86WP2 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GPBP1Q86WP2 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GPBP1Q86WP2 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GPBP1Q86WP2 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GPBP1Q86WP2 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GPBP1Q86WP2 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GPBP1Q86WP2 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
GPBP1Q86WP2 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GPBP1Q86WP2 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GPBP1Q86WP2 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms