Protein–RNA interactions for Protein: Q86VL8

SLC47A2, Multidrug and toxin extrusion protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC47A2Q86VL8 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC47A2Q86VL8 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC47A2Q86VL8 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC47A2Q86VL8 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC47A2Q86VL8 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC47A2Q86VL8 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC47A2Q86VL8 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC47A2Q86VL8 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC47A2Q86VL8 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC47A2Q86VL8 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC47A2Q86VL8 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC47A2Q86VL8 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC47A2Q86VL8 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC47A2Q86VL8 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC47A2Q86VL8 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC47A2Q86VL8 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC47A2Q86VL8 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC47A2Q86VL8 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC47A2Q86VL8 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC47A2Q86VL8 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC47A2Q86VL8 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC47A2Q86VL8 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC47A2Q86VL8 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC47A2Q86VL8 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC47A2Q86VL8 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC47A2Q86VL8 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC47A2Q86VL8 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC47A2Q86VL8 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC47A2Q86VL8 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC47A2Q86VL8 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC47A2Q86VL8 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC47A2Q86VL8 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC47A2Q86VL8 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC47A2Q86VL8 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC47A2Q86VL8 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC47A2Q86VL8 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC47A2Q86VL8 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC47A2Q86VL8 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC47A2Q86VL8 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC47A2Q86VL8 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC47A2Q86VL8 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC47A2Q86VL8 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC47A2Q86VL8 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC47A2Q86VL8 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC47A2Q86VL8 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC47A2Q86VL8 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC47A2Q86VL8 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC47A2Q86VL8 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC47A2Q86VL8 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC47A2Q86VL8 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC47A2Q86VL8 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC47A2Q86VL8 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC47A2Q86VL8 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC47A2Q86VL8 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC47A2Q86VL8 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC47A2Q86VL8 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC47A2Q86VL8 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC47A2Q86VL8 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC47A2Q86VL8 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SLC47A2Q86VL8 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SLC47A2Q86VL8 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
SLC47A2Q86VL8 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC47A2Q86VL8 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC47A2Q86VL8 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC47A2Q86VL8 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC47A2Q86VL8 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC47A2Q86VL8 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC47A2Q86VL8 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC47A2Q86VL8 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC47A2Q86VL8 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC47A2Q86VL8 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC47A2Q86VL8 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC47A2Q86VL8 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC47A2Q86VL8 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC47A2Q86VL8 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC47A2Q86VL8 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC47A2Q86VL8 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC47A2Q86VL8 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC47A2Q86VL8 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC47A2Q86VL8 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC47A2Q86VL8 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC47A2Q86VL8 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC47A2Q86VL8 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC47A2Q86VL8 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC47A2Q86VL8 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC47A2Q86VL8 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC47A2Q86VL8 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC47A2Q86VL8 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC47A2Q86VL8 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC47A2Q86VL8 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC47A2Q86VL8 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC47A2Q86VL8 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC47A2Q86VL8 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC47A2Q86VL8 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC47A2Q86VL8 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC47A2Q86VL8 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC47A2Q86VL8 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC47A2Q86VL8 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC47A2Q86VL8 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC47A2Q86VL8 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms