Protein–RNA interactions for Protein: Q86TU6

LINC00523, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00523, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00523Q86TU6 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
LINC00523Q86TU6 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LINC00523Q86TU6 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LINC00523Q86TU6 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LINC00523Q86TU6 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LINC00523Q86TU6 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
LINC00523Q86TU6 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LINC00523Q86TU6 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LINC00523Q86TU6 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LINC00523Q86TU6 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LINC00523Q86TU6 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LINC00523Q86TU6 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LINC00523Q86TU6 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LINC00523Q86TU6 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LINC00523Q86TU6 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LINC00523Q86TU6 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LINC00523Q86TU6 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LINC00523Q86TU6 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LINC00523Q86TU6 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
LINC00523Q86TU6 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LINC00523Q86TU6 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LINC00523Q86TU6 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LINC00523Q86TU6 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LINC00523Q86TU6 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LINC00523Q86TU6 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LINC00523Q86TU6 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LINC00523Q86TU6 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LINC00523Q86TU6 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LINC00523Q86TU6 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LINC00523Q86TU6 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
LINC00523Q86TU6 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LINC00523Q86TU6 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LINC00523Q86TU6 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LINC00523Q86TU6 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LINC00523Q86TU6 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LINC00523Q86TU6 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LINC00523Q86TU6 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LINC00523Q86TU6 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LINC00523Q86TU6 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LINC00523Q86TU6 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LINC00523Q86TU6 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LINC00523Q86TU6 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LINC00523Q86TU6 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
LINC00523Q86TU6 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
LINC00523Q86TU6 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
LINC00523Q86TU6 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
LINC00523Q86TU6 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
LINC00523Q86TU6 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LINC00523Q86TU6 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LINC00523Q86TU6 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LINC00523Q86TU6 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LINC00523Q86TU6 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LINC00523Q86TU6 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LINC00523Q86TU6 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LINC00523Q86TU6 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
LINC00523Q86TU6 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LINC00523Q86TU6 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LINC00523Q86TU6 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LINC00523Q86TU6 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LINC00523Q86TU6 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LINC00523Q86TU6 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LINC00523Q86TU6 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LINC00523Q86TU6 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LINC00523Q86TU6 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
LINC00523Q86TU6 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LINC00523Q86TU6 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LINC00523Q86TU6 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LINC00523Q86TU6 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LINC00523Q86TU6 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LINC00523Q86TU6 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LINC00523Q86TU6 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LINC00523Q86TU6 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LINC00523Q86TU6 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LINC00523Q86TU6 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LINC00523Q86TU6 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LINC00523Q86TU6 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LINC00523Q86TU6 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
LINC00523Q86TU6 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
LINC00523Q86TU6 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
LINC00523Q86TU6 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LINC00523Q86TU6 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LINC00523Q86TU6 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LINC00523Q86TU6 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LINC00523Q86TU6 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LINC00523Q86TU6 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LINC00523Q86TU6 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LINC00523Q86TU6 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LINC00523Q86TU6 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LINC00523Q86TU6 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LINC00523Q86TU6 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LINC00523Q86TU6 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LINC00523Q86TU6 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LINC00523Q86TU6 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LINC00523Q86TU6 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LINC00523Q86TU6 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LINC00523Q86TU6 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LINC00523Q86TU6 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LINC00523Q86TU6 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LINC00523Q86TU6 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LINC00523Q86TU6 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms